More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2115 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
254 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.16 
 
 
259 aa  249  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0240  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.21 
 
 
265 aa  248  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0281  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.44 
 
 
265 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11671  normal  0.186449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.98 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  44.88 
 
 
257 aa  208  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.63 
 
 
261 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
273 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6323  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
261 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0881362  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
260 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.74 
 
 
253 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
260 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  38.96 
 
 
266 aa  154  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3457  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 
249 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.735617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 
261 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 
260 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.63 
 
 
259 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.69 
 
 
260 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  47.7 
 
 
256 aa  150  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 
267 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.61 
 
 
260 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 
268 aa  148  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.2 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.39 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.71 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
263 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 
259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
260 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
269 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 
260 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 
257 aa  144  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1378  methylmalonyl-CoA decarboxylase  36.76 
 
 
260 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
260 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
260 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 
260 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  37.14 
 
 
261 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  40.56 
 
 
260 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.58 
 
 
260 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
260 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
261 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 
258 aa  142  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 
261 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  37.35 
 
 
258 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 
259 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  37.35 
 
 
258 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.74 
 
 
260 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
266 aa  142  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.75 
 
 
265 aa  141  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
262 aa  141  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
260 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 
260 aa  141  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  36.48 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.95 
 
 
275 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 
260 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  34.54 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0587  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.08 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
273 aa  139  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 
259 aa  139  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
258 aa  138  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 
259 aa  138  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
257 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
260 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
274 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  38.64 
 
 
260 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.02 
 
 
260 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 
259 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.33 
 
 
659 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
261 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
264 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
257 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.2 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 
259 aa  135  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.19 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.62 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>