More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0758 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 259 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229478  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  45.56 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2612  enoyl-CoA hydratase-isomerase  49.61 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40881  normal  0.0709716 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  45.45 
 
 		 255 aa  208  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.06 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  45.06 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2625  enoyl-CoA hydratase-isomerase  50 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  49.22 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  45.06 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  49.22 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.63 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  43.08 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0655  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  41.7 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  42.34 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.35 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09128  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01210)  42.21 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  42.04 
 
 		 269 aa  181  7e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.49 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  42.29 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.68 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.61 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.35 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.76 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 		 257 aa  175  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.68 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  40.55 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  41.5 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.09 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.19 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 		 259 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 		 257 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 251 aa  171  7.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  40.65 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 		 258 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  41.41 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.34 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  38.82 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 259 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.37 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.62 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.61 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  40.94 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  38.84 
 
 		 663 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05916  enoyl-CoA hydratase (Eurofung)  36.12 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.37 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2905  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.433912  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5078  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.68 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 		 260 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.02 
 
 		 260 aa  161  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.29 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.3 
 
 		 662 aa  161  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 		 261 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.82 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0774  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.730514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.38 
 
 		 662 aa  160  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  39.43 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.43 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>