More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2694 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 275 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  75.27 
 
 		 275 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  75.55 
 
 		 275 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  74.91 
 
 		 275 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  73.98 
 
 		 273 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  62.69 
 
 		 266 aa  322  4e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.36 
 
 		 273 aa  315  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.81 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.46 
 
 		 263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.82 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  59.62 
 
 		 261 aa  285  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.31 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.6 
 
 		 266 aa  278  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.84 
 
 		 260 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.22 
 
 		 266 aa  277  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.22 
 
 		 270 aa  275  8e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  53.46 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.32 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  52.45 
 
 		 262 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  54.79 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.69 
 
 		 265 aa  265  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.44 
 
 		 269 aa  265  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  57.53 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.87 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  58.78 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.32 
 
 		 262 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  54.34 
 
 		 261 aa  254  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  51.75 
 
 		 274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  54.34 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  54.34 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  51.27 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 		 264 aa  252  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  54.05 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  51.16 
 
 		 261 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  53.49 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.38 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  49.03 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  52.49 
 
 		 272 aa  248  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  52.49 
 
 		 272 aa  248  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  52.69 
 
 		 269 aa  248  6e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  54.05 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  54.15 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 		 277 aa  244  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  51.71 
 
 		 278 aa  244  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  54.55 
 
 		 269 aa  244  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.96 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  54.94 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.36 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  50.39 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.03 
 
 		 270 aa  242  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  53.23 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.9 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  50.57 
 
 		 264 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 		 264 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 		 290 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 		 290 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  50.57 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 		 264 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  52.12 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.6 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  49.03 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.8 
 
 		 270 aa  228  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.84 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.43 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.14 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.84 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.7 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  42.52 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 258 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.3 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 		 264 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  35 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 		 258 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 		 258 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1765  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.09 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  31.06 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 		 255 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 		 255 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 		 255 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>