More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6127 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
255 aa  508  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  77.08 
 
 
257 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.67 
 
 
257 aa  335  5.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.13 
 
 
263 aa  296  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  51.98 
 
 
264 aa  249  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.76 
 
 
269 aa  215  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.79 
 
 
269 aa  211  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.79 
 
 
269 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  50.21 
 
 
272 aa  205  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.79 
 
 
272 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 
273 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.75 
 
 
269 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  46.67 
 
 
273 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.74 
 
 
274 aa  203  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  48.56 
 
 
270 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  45.97 
 
 
262 aa  202  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.5 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  50.62 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  46.06 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  48.99 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
275 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.8 
 
 
270 aa  194  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
269 aa  194  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  47.11 
 
 
269 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  46.28 
 
 
269 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  48.36 
 
 
269 aa  190  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  51.71 
 
 
257 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  44.84 
 
 
275 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.5 
 
 
262 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  46.91 
 
 
278 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 
275 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.88 
 
 
263 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  43.25 
 
 
275 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  46.91 
 
 
266 aa  188  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  46.61 
 
 
266 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 
264 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.03 
 
 
273 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
265 aa  185  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  48.97 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.74 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 
272 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 
272 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  45.68 
 
 
264 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.27 
 
 
260 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  45.27 
 
 
264 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  45.78 
 
 
261 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  45.78 
 
 
261 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  45.78 
 
 
261 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.8 
 
 
276 aa  178  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  45.68 
 
 
264 aa  178  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.86 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.27 
 
 
260 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 
264 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  41.95 
 
 
274 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  43.81 
 
 
273 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.86 
 
 
261 aa  164  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.44 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  40.73 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  41.54 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.27 
 
 
270 aa  162  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  45.9 
 
 
261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
261 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 
261 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.26 
 
 
260 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.8 
 
 
266 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 
265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
259 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 
259 aa  122  5e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.81 
 
 
257 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
260 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0110  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.549312  normal  0.683018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 
260 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
260 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 
265 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
264 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.39 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0102  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17860  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.92 
 
 
262 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213095  normal  0.535788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>