More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0102 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0102  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 259 aa  521  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  93.82 
 
 		 259 aa  490  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0041  enoyl-CoA hydratase  68.11 
 
 		 263 aa  333  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2206  enoyl-CoA hydratase  57.36 
 
 		 259 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0233003  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3258  enoyl-CoA hydratase  57.31 
 
 		 259 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2437  enoyl-CoA hydratase  57.09 
 
 		 259 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3199  enoyl-CoA hydratase  59.69 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0460733  normal  0.284798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5736  enoyl-CoA hydratase  53.88 
 
 		 259 aa  284  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.31 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.26 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.36 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.3 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4432  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4387  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0213556  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.52 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 		 264 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 261 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0912  naphthoate synthase  36.19 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.092423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.36 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 		 273 aa  135  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 		 278 aa  135  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 261 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.33 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2831  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.21 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  38.26 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 		 260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 		 273 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.47 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  36.89 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  38.84 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3297  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 263 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 257 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 		 264 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 		 268 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4874  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.75 
 
 		 268 aa  128  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2694  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2709  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2664  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>