More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3199 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3199  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 259 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0460733  normal  0.284798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2206  enoyl-CoA hydratase  85.71 
 
 		 259 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0233003  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3258  enoyl-CoA hydratase  84.56 
 
 		 259 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2437  enoyl-CoA hydratase  84.94 
 
 		 259 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5736  enoyl-CoA hydratase  83.01 
 
 		 259 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0102  enoyl-CoA hydratase  59.69 
 
 		 259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  59.3 
 
 		 259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0041  enoyl-CoA hydratase  54.98 
 
 		 263 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.2 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.85 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.39 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 266 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.2 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  39.2 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  39.2 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0912  naphthoate synthase  38.82 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.092423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2031  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  38.64 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 266 aa  141  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 		 258 aa  141  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4432  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4387  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0213556  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  39.08 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.33 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 		 261 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3297  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  38.02 
 
 		 261 aa  135  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  38.02 
 
 		 261 aa  135  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  37.64 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.02 
 
 		 261 aa  135  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  38.02 
 
 		 261 aa  135  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  38.02 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  38.02 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  38.02 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.5 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  36.5 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.5 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  36.5 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  36.5 
 
 		 261 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 		 261 aa  131  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3088  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  35.69 
 
 		 272 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.63 
 
 		 269 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 		 260 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.3 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 		 278 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>