More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0041 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0041  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
263 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  68.9 
 
 
259 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0102  enoyl-CoA hydratase  68.11 
 
 
259 aa  346  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2437  enoyl-CoA hydratase  55.78 
 
 
259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3258  enoyl-CoA hydratase  55.38 
 
 
259 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686991  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2206  enoyl-CoA hydratase  54.98 
 
 
259 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0233003  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5736  enoyl-CoA hydratase  54.58 
 
 
259 aa  275  8e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112015  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3199  enoyl-CoA hydratase  54.98 
 
 
259 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0460733  normal  0.284798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
255 aa  198  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
264 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4387  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0213556  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
266 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4432  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 
275 aa  139  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230876  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
255 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
255 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
255 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.14 
 
 
255 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.83 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 
257 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 
266 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 
252 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
797 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
287 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
257 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.87 
 
 
261 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.61 
 
 
257 aa  131  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 
266 aa  131  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  34.31 
 
 
269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  34.31 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  34.31 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2831  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
262 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
261 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
261 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
257 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
262 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
263 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3139  enoyl-CoA hydratase  35.39 
 
 
249 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
260 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4851  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
273 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635885 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
274 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4309  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
255 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.979259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4395  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
255 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  34 
 
 
258 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
275 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
269 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4689  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
255 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552006  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
273 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
260 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
260 aa  122  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 
249 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.39 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  32.61 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2837  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
264 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
257 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.8 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3297  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 
273 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
261 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 
258 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
290 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
290 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2902  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.04 
 
 
650 aa  118  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
260 aa  118  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  29.89 
 
 
663 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0655  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1904  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302321  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2640  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>