More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4721 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 262 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  78.95 
 
 		 260 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  76.26 
 
 		 260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  73.44 
 
 		 260 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  69.23 
 
 		 288 aa  374  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  71.54 
 
 		 261 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  72.76 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  72.31 
 
 		 259 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.45 
 
 		 273 aa  342  4e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  63.32 
 
 		 264 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  62.79 
 
 		 264 aa  334  9e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  60.08 
 
 		 264 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  58.53 
 
 		 268 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  64.9 
 
 		 263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4353  enoyl-CoA hydratase  65.5 
 
 		 267 aa  319  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  58.69 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  61.78 
 
 		 262 aa  311  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.16 
 
 		 262 aa  304  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 		 261 aa  298  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  60.23 
 
 		 262 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  53.67 
 
 		 261 aa  291  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  52.9 
 
 		 261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.21 
 
 		 263 aa  288  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 		 261 aa  288  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.43 
 
 		 273 aa  265  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5034  enoyl-CoA hydratase  54.05 
 
 		 261 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3129  enoyl-CoA hydratase  54.05 
 
 		 261 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114745  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5238  enoyl-CoA hydratase  54.05 
 
 		 261 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  normal  0.97533 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  54.05 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4586  enoyl-CoA hydratase  56.37 
 
 		 261 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5119  enoyl-CoA hydratase  55.98 
 
 		 261 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 266 aa  256  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.19 
 
 		 263 aa  255  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  53.88 
 
 		 275 aa  255  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1601  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.36 
 
 		 262 aa  231  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0090  enoyl-CoA hydratase  48.85 
 
 		 261 aa  231  8.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1507  enoyl-CoA hydratase  51.15 
 
 		 261 aa  231  8.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20368  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.69 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.34 
 
 		 281 aa  228  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0383  enoyl-CoA hydratase  48.45 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0361289  hitchhiker  0.00761881 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3225  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.02 
 
 		 279 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  46.34 
 
 		 279 aa  224  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0750  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2247  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.82 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.75 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.05 
 
 		 269 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2830  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2975  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44 
 
 		 289 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.517707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1456  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.09 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1528  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.837237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  42.47 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1071  methylglutaconyl-CoA hydratase  41.73 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0963  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.73 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2799  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.08 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2729  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 		 270 aa  215  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1670  methylglutaconyl-CoA hydratase  44 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2396  methylglutaconyl-CoA hydratase  44 
 
 		 286 aa  214  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1717  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.6 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2324  methylglutaconyl-CoA hydratase  44 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.14 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1895  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.2 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1515  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.39 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.320841  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.27 
 
 		 266 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.27 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00100  enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0191435  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 		 266 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.72 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  41.6 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3658  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  43.27 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551488  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 		 264 aa  201  8e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 		 264 aa  201  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2031  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3664  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  42.45 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705793  hitchhiker  0.000000000357336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4066  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  42.45 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1775  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  42.45 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  hitchhiker  0.0077103 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1792  hypothetical protein  40.47 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.27 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.27 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4528  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.27 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0222933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0889  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.61 
 
 		 275 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65979 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1791  hypothetical protein  40.86 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1810  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404881  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2737  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.22 
 
 		 282 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2468  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  42.04 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.680829  normal  0.0128185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2941  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.15 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0701777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0041  enoyl-CoA hydratase  41.54 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>