More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2117 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 262 aa  532  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  64.11 
 
 		 264 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  62.9 
 
 		 264 aa  321  8e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  62.9 
 
 		 264 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  62.25 
 
 		 268 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  61.04 
 
 		 268 aa  318  7e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  62.2 
 
 		 261 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 		 260 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  59.26 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.69 
 
 		 261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  63.56 
 
 		 262 aa  304  8.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.16 
 
 		 262 aa  304  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  63.56 
 
 		 262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  57.6 
 
 		 260 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  56.2 
 
 		 258 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  58.13 
 
 		 261 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  57.89 
 
 		 261 aa  301  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  57.49 
 
 		 260 aa  300  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.06 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  59.51 
 
 		 261 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  59.51 
 
 		 261 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  59.51 
 
 		 261 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  59.51 
 
 		 261 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  59.51 
 
 		 261 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  59.51 
 
 		 261 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  59.51 
 
 		 261 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  55.47 
 
 		 288 aa  288  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  58.3 
 
 		 261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5034  enoyl-CoA hydratase  59.51 
 
 		 261 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3129  enoyl-CoA hydratase  59.51 
 
 		 261 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114745  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5238  enoyl-CoA hydratase  59.51 
 
 		 261 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  normal  0.97533 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  56.32 
 
 		 263 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  59.11 
 
 		 261 aa  278  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4353  enoyl-CoA hydratase  60.32 
 
 		 267 aa  275  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.02 
 
 		 273 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4586  enoyl-CoA hydratase  59.76 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5119  enoyl-CoA hydratase  59.76 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.57 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1601  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  49.59 
 
 		 262 aa  263  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.58 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.59 
 
 		 263 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.22 
 
 		 261 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.19 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0750  enoyl-CoA hydratase  47.51 
 
 		 263 aa  231  9e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.37 
 
 		 262 aa  228  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  49.39 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2031  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0889  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.72 
 
 		 275 aa  221  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1810  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404881  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1895  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.31 
 
 		 288 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1670  methylglutaconyl-CoA hydratase  45.12 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.13 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4066  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3664  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  43.19 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705793  hitchhiker  0.000000000357336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1775  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  hitchhiker  0.0077103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2396  methylglutaconyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 286 aa  218  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  45.49 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1717  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.9 
 
 		 288 aa  218  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0090  enoyl-CoA hydratase  46.74 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2324  methylglutaconyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.34 
 
 		 276 aa  216  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.53 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3225  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.5 
 
 		 279 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2830  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.9 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.9 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2975  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.9 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.517707 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  43.55 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3658  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 		 271 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551488  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1528  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.9 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.837237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0383  enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0361289  hitchhiker  0.00761881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2468  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  41.31 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.680829  normal  0.0128185 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0963  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.34 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1071  methylglutaconyl-CoA hydratase  42.34 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1456  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.56 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1507  enoyl-CoA hydratase  47.13 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20368  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2247  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.5 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0223  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.75 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1515  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.37 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.320841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2737  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.77 
 
 		 282 aa  208  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.37 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2799  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.87 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  43.36 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.28 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.28 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2941  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0701777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490651  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1792  hypothetical protein  43.09 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1631  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.53 
 
 		 276 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0595398  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  41.87 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  41.87 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1791  hypothetical protein  43.5 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2729  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.04 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4528  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0222933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>