More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5119 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5119  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
261 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21776  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4586  enoyl-CoA hydratase  98.85 
 
 
261 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  96.55 
 
 
261 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3129  enoyl-CoA hydratase  95.02 
 
 
261 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114745  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5034  enoyl-CoA hydratase  95.02 
 
 
261 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5238  enoyl-CoA hydratase  95.02 
 
 
261 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  normal  0.97533 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  95.02 
 
 
261 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  81.54 
 
 
261 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  81.54 
 
 
261 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  81.15 
 
 
261 aa  418  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  81.54 
 
 
261 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  81.54 
 
 
261 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  81.54 
 
 
261 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  81.54 
 
 
261 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  81.54 
 
 
261 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  68.2 
 
 
261 aa  363  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  68.85 
 
 
261 aa  362  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  67.43 
 
 
261 aa  359  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  65.76 
 
 
264 aa  331  7.000000000000001e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  66.92 
 
 
262 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  67.69 
 
 
262 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  64.98 
 
 
264 aa  326  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  64.59 
 
 
264 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.38 
 
 
273 aa  310  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  59.45 
 
 
259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  58.2 
 
 
260 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  56.2 
 
 
268 aa  300  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  58.2 
 
 
260 aa  299  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  58.94 
 
 
258 aa  295  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  59.35 
 
 
260 aa  294  8e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.14 
 
 
261 aa  293  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  55.43 
 
 
268 aa  293  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.51 
 
 
262 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  55.56 
 
 
288 aa  284  9e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.98 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  58.3 
 
 
263 aa  278  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.07 
 
 
273 aa  278  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4353  enoyl-CoA hydratase  60.31 
 
 
267 aa  271  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.92 
 
 
263 aa  262  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.4 
 
 
266 aa  255  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.21 
 
 
263 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  53.94 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1071  methylglutaconyl-CoA hydratase  45.1 
 
 
256 aa  236  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0963  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45.1 
 
 
256 aa  236  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1601  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45.53 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0889  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.37 
 
 
275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0383  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 
259 aa  231  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0361289  hitchhiker  0.00761881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0750  enoyl-CoA hydratase  51.74 
 
 
263 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  43.25 
 
 
260 aa  228  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.72 
 
 
281 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  44.72 
 
 
279 aa  226  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.19 
 
 
266 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.78 
 
 
266 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1507  enoyl-CoA hydratase  50.96 
 
 
261 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20368  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 
269 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.78 
 
 
266 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.33 
 
 
266 aa  222  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.78 
 
 
266 aa  222  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.22 
 
 
261 aa  220  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.59 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.59 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4528  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.59 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0222933  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.31 
 
 
262 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.15 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2830  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.15 
 
 
290 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.19 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2799  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.5 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.15 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2975  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.15 
 
 
289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.517707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1528  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.15 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.837237  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1717  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.32 
 
 
288 aa  209  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1515  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.8 
 
 
262 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.320841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
265 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
265 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2396  methylglutaconyl-CoA hydratase  43.72 
 
 
286 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2324  methylglutaconyl-CoA hydratase  43.72 
 
 
281 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0090  enoyl-CoA hydratase  49.03 
 
 
261 aa  208  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1791  hypothetical protein  44 
 
 
276 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1670  methylglutaconyl-CoA hydratase  43.32 
 
 
286 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1895  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.51 
 
 
288 aa  206  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1456  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.4 
 
 
279 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3225  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
279 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1792  hypothetical protein  43.2 
 
 
276 aa  205  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 
266 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  45 
 
 
265 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2247  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.34 
 
 
272 aa  202  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  43.63 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  43.63 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2729  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2031  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 
266 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4066  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  41.31 
 
 
271 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000891346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1775  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  41.31 
 
 
271 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  hitchhiker  0.0077103 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0041  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
264 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568565  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3658  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
271 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551488  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0977  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 
256 aa  194  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3664  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  41.31 
 
 
271 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705793  hitchhiker  0.000000000357336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00100  enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 
265 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0191435  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  43.3 
 
 
261 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49530  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  42.69 
 
 
264 aa  192  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107065  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0223  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.35 
 
 
265 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>