More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2206 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2206  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 259 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0233003  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3258  enoyl-CoA hydratase  92.66 
 
 		 259 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2437  enoyl-CoA hydratase  89.96 
 
 		 259 aa  487  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5736  enoyl-CoA hydratase  84.56 
 
 		 259 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3199  enoyl-CoA hydratase  85.71 
 
 		 259 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0460733  normal  0.284798 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  57.75 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0102  enoyl-CoA hydratase  57.36 
 
 		 259 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0041  enoyl-CoA hydratase  54.98 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.07 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.92 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 		 255 aa  164  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4432  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 		 275 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  39.27 
 
 		 263 aa  148  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 270 aa  148  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 		 262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.92 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  36.07 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.75 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2031  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 		 266 aa  141  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4387  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 275 aa  141  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0213556  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  35.1 
 
 		 269 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 		 265 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.06 
 
 		 269 aa  138  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  36.48 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0912  naphthoate synthase  38.26 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.092423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3088  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3658  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551488  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1895  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.42 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3664  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705793  hitchhiker  0.000000000357336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  36.48 
 
 		 288 aa  135  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 		 261 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 		 270 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  37.6 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1210  naphthoate synthase  34.09 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4066  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0889  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.97 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1775  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 		 271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  hitchhiker  0.0077103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  34.87 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>