More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4432 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4432  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
275 aa  568  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230876  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4387  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.81 
 
 
275 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0213556  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2437  enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 
259 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2206  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
259 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0233003  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5736  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112015  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3258  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
259 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686991  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
259 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0102  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
259 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.51 
 
 
264 aa  138  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  32.59 
 
 
266 aa  138  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  32.11 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.94 
 
 
271 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0041  enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 
263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
259 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.21 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.88 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3199  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0460733  normal  0.284798 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4353  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 
267 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  30.95 
 
 
261 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.37 
 
 
259 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 
264 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  28.63 
 
 
261 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
254 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
263 aa  123  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
249 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
249 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
249 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  29.73 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  29.76 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4874  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 
268 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.69 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2546  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
259 aa  119  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 
269 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 
269 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 
269 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  29.77 
 
 
261 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  29.57 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.66 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  29.43 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  29.01 
 
 
261 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  30.36 
 
 
268 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2694  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  29.76 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2664  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106176  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  28.91 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2709  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.47 
 
 
260 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.15 
 
 
281 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
260 aa  115  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 
261 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  28.68 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  28.74 
 
 
279 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3210  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  29.22 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.324324  normal  0.0213187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  29.23 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.69 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.24 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.84 
 
 
252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.53 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3459  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  29.23 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.35 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2610  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0699041  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  29.55 
 
 
261 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 
273 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1984  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.31 
 
 
270 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.928303  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.67 
 
 
269 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.95 
 
 
261 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  31.84 
 
 
297 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.15 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  29.17 
 
 
268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1307  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.53 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5034  enoyl-CoA hydratase  28.63 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3129  enoyl-CoA hydratase  28.63 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114745  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1765  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.85 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5238  enoyl-CoA hydratase  28.63 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  normal  0.97533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.85 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82012  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.85 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  31.84 
 
 
261 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.46 
 
 
273 aa  112  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  31.84 
 
 
261 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.86 
 
 
266 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.1 
 
 
266 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  31.84 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  31.84 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  31.84 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>