More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3459 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3459  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
260 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  91.89 
 
 
260 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.388199  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5459  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.58 
 
 
259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.622962  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12770  Enoyl-CoA hydratase  57.36 
 
 
260 aa  268  8.999999999999999e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4874  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.17 
 
 
268 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.54 
 
 
253 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  52.73 
 
 
267 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.69 
 
 
255 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4532  enoyl-CoA hydratase  48.61 
 
 
255 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4395  enoyl-CoA hydratase  46.85 
 
 
255 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4309  enoyl-CoA hydratase  46.85 
 
 
255 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.979259  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1635  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.25 
 
 
256 aa  195  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4689  enoyl-CoA hydratase  46.85 
 
 
255 aa  194  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552006  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4851  enoyl-CoA hydratase  45.42 
 
 
273 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4435  enoyl-CoA hydratase  48.44 
 
 
272 aa  188  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10989  enoyl-CoA hydratase  45.16 
 
 
269 aa  186  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00102369  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.76 
 
 
255 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2831  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.04 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3297  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.69 
 
 
273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1880  enoyl-CoA hydratase  45.25 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0910534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3139  enoyl-CoA hydratase  43.6 
 
 
249 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3826  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.35 
 
 
272 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 
268 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
268 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  38.8 
 
 
261 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
263 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 
261 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 
258 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
260 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 
264 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.19 
 
 
262 aa  150  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.666985  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 
261 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 
261 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 
261 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 
261 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 
261 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 
261 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 
261 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
263 aa  146  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0862  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0132553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
260 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 
264 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2511  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 
262 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 
262 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 
261 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
273 aa  144  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
261 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
263 aa  142  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 
262 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.65 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
288 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2008  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 
261 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  39.38 
 
 
261 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
261 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 
262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  39.38 
 
 
275 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
262 aa  135  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3129  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
261 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114745  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5034  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
261 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5238  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
261 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  normal  0.97533 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4353  enoyl-CoA hydratase  38.98 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 
266 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3658  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 
271 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551488  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.72 
 
 
266 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3664  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 
271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705793  hitchhiker  0.000000000357336 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2468  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
291 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.680829  normal  0.0128185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0977  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
256 aa  128  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2031  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.2 
 
 
266 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
258 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490651  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1775  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  hitchhiker  0.0077103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4066  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
271 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000891346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1810  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 
271 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404881  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3825  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
256 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000788049 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
263 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
259 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1150  enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 
260 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.283717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0750  enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 
263 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5736  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
259 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112015  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
261 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>