More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3826 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3826  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
272 aa  533  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4689  enoyl-CoA hydratase  57.48 
 
 
255 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552006  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4395  enoyl-CoA hydratase  57.48 
 
 
255 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4309  enoyl-CoA hydratase  57.48 
 
 
255 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.979259  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1880  enoyl-CoA hydratase  57.87 
 
 
257 aa  258  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0910534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4851  enoyl-CoA hydratase  55.91 
 
 
273 aa  258  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4435  enoyl-CoA hydratase  55.81 
 
 
272 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10989  enoyl-CoA hydratase  56.33 
 
 
269 aa  248  8e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00102369  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2831  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.19 
 
 
262 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3139  enoyl-CoA hydratase  49.61 
 
 
249 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4532  enoyl-CoA hydratase  45.78 
 
 
255 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 
267 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.94 
 
 
253 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12770  Enoyl-CoA hydratase  43.32 
 
 
260 aa  171  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3459  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.35 
 
 
260 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 
260 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.388199  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.42 
 
 
255 aa  168  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4874  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.41 
 
 
268 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 
264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3297  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.38 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.09 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
273 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 
264 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
268 aa  158  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5459  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
259 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.622962  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
260 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
261 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  38.82 
 
 
261 aa  151  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.08 
 
 
255 aa  151  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
259 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 
262 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
268 aa  149  6e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
262 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 
261 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
288 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
261 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.78 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5238  enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  normal  0.97533 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5034  enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3129  enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2546  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
262 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
261 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
265 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2799  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
292 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1456  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
279 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3225  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
279 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
258 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490651  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0862  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0132553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.086276  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.2 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1635  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
263 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00100  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
265 aa  125  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0191435  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
260 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5119  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
261 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21776  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0750  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 
263 aa  125  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4586  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
263 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.57 
 
 
290 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0318  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 
270 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 
266 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2830  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.57 
 
 
290 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2264  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
264 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2247  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.55 
 
 
272 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.47 
 
 
262 aa  123  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.666985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 
266 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26690  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
264 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54358  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2975  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
289 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.517707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1528  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
293 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.837237  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2974  methylglutaconyl-CoA hydratase  30.5 
 
 
258 aa  122  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.240508 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2729  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.19 
 
 
270 aa  122  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.23 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>