More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2546 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2546  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 259 aa  524  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.3 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2974  methylglutaconyl-CoA hydratase  50.79 
 
 		 258 aa  266  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.240508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.06 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.34 
 
 		 260 aa  221  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.52 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.32 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 		 268 aa  178  8e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  35.22 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  34.41 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 		 258 aa  165  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 		 260 aa  162  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  34.41 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 		 260 aa  158  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  35.66 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490651  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0977  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.52 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1601  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.91 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.58 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3825  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.15 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000788049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1515  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.320841  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  32.42 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  30.6 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2831  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 		 273 aa  142  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 		 266 aa  141  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 		 261 aa  141  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0963  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.22 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1071  methylglutaconyl-CoA hydratase  32.22 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 261 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0041  enoyl-CoA hydratase  30.28 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568565  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1150  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4353  enoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 		 267 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  29.62 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2511  enoyl-CoA hydratase  29.23 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2247  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4435  enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 		 272 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  30.28 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  30.28 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4874  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1775  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  30.36 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  hitchhiker  0.0077103 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12770  Enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4066  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  30.36 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891346 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1792  hypothetical protein  34.12 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3826  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3664  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705793  hitchhiker  0.000000000357336 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1791  hypothetical protein  34.12 
 
 		 276 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5034  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4528  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0222933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.18 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3129  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114745  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5238  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  normal  0.97533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3225  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.59 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  31.54 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4851  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 		 273 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1810  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  29.15 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404881  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3139  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 		 249 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1729  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.54 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29424  normal  0.413397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>