More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2974 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2974  methylglutaconyl-CoA hydratase  100 
 
 
258 aa  528  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.240508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.75 
 
 
259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2546  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.79 
 
 
259 aa  266  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
262 aa  246  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.49 
 
 
260 aa  201  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 
254 aa  175  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
257 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 
268 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
263 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 
258 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490651  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0977  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 
261 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
260 aa  162  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 
264 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 
264 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
260 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
261 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
263 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5238  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
261 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  normal  0.97533 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3129  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
261 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114745  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5034  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
261 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3825  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 
256 aa  158  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000788049 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1071  methylglutaconyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
256 aa  158  9e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0963  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.6 
 
 
256 aa  158  9e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
259 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
261 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
273 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
275 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 
261 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
261 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
261 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
261 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
261 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
261 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
261 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
261 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
261 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.42 
 
 
261 aa  151  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
260 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 
261 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
264 aa  149  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
264 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0041  enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 
264 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568565  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 
266 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 
288 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5119  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 
261 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21776  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2247  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.52 
 
 
272 aa  145  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.84 
 
 
269 aa  145  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4586  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
261 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3225  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.73 
 
 
266 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4353  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
267 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 
267 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.05 
 
 
266 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
262 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  31.45 
 
 
260 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1792  hypothetical protein  36.86 
 
 
276 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  32.57 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4528  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 
266 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0222933  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 
266 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 
266 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.84 
 
 
266 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1791  hypothetical protein  36.08 
 
 
276 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1456  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
279 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.23 
 
 
261 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.47 
 
 
262 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.84 
 
 
266 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2799  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 
292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
253 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.24 
 
 
266 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0889  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.28 
 
 
275 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65979 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
262 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2511  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
262 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.08 
 
 
262 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1800  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.731104  normal  0.6989 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  31.45 
 
 
279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2324  methylglutaconyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2468  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
291 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.680829  normal  0.0128185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2396  methylglutaconyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
286 aa  131  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1670  methylglutaconyl-CoA hydratase  31.68 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1895  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.06 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2737  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.92 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3658  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551488  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1717  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2729  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.68 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>