More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2264 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2264  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
264 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26690  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
264 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54358  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  81.37 
 
 
265 aa  410  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.086276  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3949  enoyl-CoA hydratase/isomerase  74.05 
 
 
265 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.10876  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2806  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.55 
 
 
274 aa  302  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0318  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.51 
 
 
270 aa  266  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2816  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.53 
 
 
278 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23774  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.42 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1723  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
277 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0376622  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
281 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
269 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
265 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 
262 aa  149  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
262 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 
260 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 
264 aa  148  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4192  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.415439 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0740  enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 
264 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 
264 aa  145  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
268 aa  145  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2830  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
290 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
261 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1670  methylglutaconyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
286 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2031  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  40.39 
 
 
266 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
261 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2396  methylglutaconyl-CoA hydratase  34.85 
 
 
286 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 
273 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
290 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 
262 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2975  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
289 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.517707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1528  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
293 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.837237  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2468  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
291 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.680829  normal  0.0128185 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
261 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1895  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.47 
 
 
288 aa  142  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2737  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.31 
 
 
282 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1717  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 
288 aa  142  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2324  methylglutaconyl-CoA hydratase  35.46 
 
 
281 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
260 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2247  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
272 aa  141  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
260 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2799  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
261 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1456  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
279 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 
261 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 
260 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
262 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
259 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0041  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
264 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568565  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 
276 aa  136  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  41.54 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1810  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404881  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.18 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0287  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.53 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2931  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.31 
 
 
280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834193  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0889  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 
275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3658  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  38.8 
 
 
271 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551488  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
266 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2511  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
262 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3225  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
279 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
261 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
261 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
261 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
261 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
261 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
261 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
261 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
279 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2776  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.31 
 
 
280 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1151  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 
280 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2008  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
262 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2941  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0701777  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  35.22 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1775  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  38 
 
 
271 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  hitchhiker  0.0077103 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 
266 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4066  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  38 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000891346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2729  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1304  enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216289  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.89 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>