More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2816 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2816  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 278 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3949  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.01 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.10876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2806  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.23 
 
 		 274 aa  236  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420844  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.82 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.086276  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2264  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.52 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26690  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.52 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0318  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.96 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.36 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 		 263 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.09 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.82 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 		 264 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 261 aa  148  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  38.01 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  37 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  37 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  37 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  37 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  37 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  37 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  37 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.63 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0287  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.38 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  36.53 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490651  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2247  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.07 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4353  enoyl-CoA hydratase  40.07 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1723  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.7 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0376622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4192  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.42 
 
 		 285 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.415439 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.3 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0740  enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 		 261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2511  enoyl-CoA hydratase  35.64 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2931  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.38 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.49 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3825  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000788049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2776  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.38 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1151  enoyl-CoA hydratase  42.38 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2941  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0701777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  32.48 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0977  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.96 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.54 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  32.71 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2008  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0223  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 		 265 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.53 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 		 269 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1800  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.21 
 
 		 260 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.731104  normal  0.6989 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.79 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1150  enoyl-CoA hydratase  39.27 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 263 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.45 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  34.56 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3664  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  32.85 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705793  hitchhiker  0.000000000357336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.87 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2031  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1631  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0595398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3129  enoyl-CoA hydratase  32.97 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2729  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.27 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5034  enoyl-CoA hydratase  32.97 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5238  enoyl-CoA hydratase  32.97 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  normal  0.97533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1670  methylglutaconyl-CoA hydratase  30.07 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1810  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404881  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4066  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891346 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1071  methylglutaconyl-CoA hydratase  36.08 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1507  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20368  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2830  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.66 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0963  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.08 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4586  enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.612429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>