More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1723 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1723  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 277 aa  547  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0376622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  76.3 
 
 		 281 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.6 
 
 		 275 aa  319  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2806  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2264  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26690  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3949  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 		 265 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.10876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0318  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.086276  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2931  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.95 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834193  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4192  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.29 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.415439 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2776  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.95 
 
 		 280 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1151  enoyl-CoA hydratase  46.95 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0287  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.95 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2816  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.7 
 
 		 278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23774  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  34.73 
 
 		 260 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1601  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.92 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.57 
 
 		 263 aa  136  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  32.55 
 
 		 279 aa  135  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 268 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  32.57 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 		 266 aa  132  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.83 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 		 262 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2737  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.63 
 
 		 282 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2468  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.680829  normal  0.0128185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2396  methylglutaconyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1670  methylglutaconyl-CoA hydratase  32.94 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1717  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 		 273 aa  122  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  32.4 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2324  methylglutaconyl-CoA hydratase  32.94 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0740  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1895  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.14 
 
 		 288 aa  118  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2511  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2247  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3658  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551488  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2031  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.45 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  35.22 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3153  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.47 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1456  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.13 
 
 		 279 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2008  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2975  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.517707 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2830  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.62 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1528  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.837237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4066  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00100  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0191435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2799  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1775  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  hitchhiker  0.0077103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1810  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404881  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0963  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.47 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1071  methylglutaconyl-CoA hydratase  32.47 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1304  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216289  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3664  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705793  hitchhiker  0.000000000357336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4435  enoyl-CoA hydratase  43.86 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4689  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552006  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  34.98 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  34.53 
 
 		 267 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2729  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3459  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4395  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  37.61 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4309  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.979259  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  32 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.93 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  32 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>