More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0740 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0740  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  66.67 
 
 		 262 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2511  enoyl-CoA hydratase  66.28 
 
 		 262 aa  351  8e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  67.32 
 
 		 260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1150  enoyl-CoA hydratase  69.92 
 
 		 260 aa  324  7e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283717 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2008  enoyl-CoA hydratase  63.95 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1304  enoyl-CoA hydratase  68.87 
 
 		 262 aa  317  9e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216289  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  59.69 
 
 		 264 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  59.69 
 
 		 264 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0041  enoyl-CoA hydratase  60.08 
 
 		 264 aa  295  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568565  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  56.2 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  54.26 
 
 		 265 aa  265  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.47 
 
 		 263 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00100  enoyl-CoA hydratase  46.33 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0191435  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.6 
 
 		 261 aa  205  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.08 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  41.86 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.28 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  43.63 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  43.24 
 
 		 264 aa  198  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  40.53 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  40.53 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2031  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490651  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  43.56 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  43.2 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  40.55 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  42.02 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3664  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705793  hitchhiker  0.000000000357336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  41.54 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1775  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  hitchhiker  0.0077103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4066  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1601  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.53 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2247  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 		 262 aa  181  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3658  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551488  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.25 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1810  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404881  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.38 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 		 266 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  39.43 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  41.54 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4528  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0222933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2830  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 		 290 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5034  enoyl-CoA hydratase  42.15 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0977  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3129  enoyl-CoA hydratase  42.15 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114745  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2975  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.517707 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5238  enoyl-CoA hydratase  42.15 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  normal  0.97533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1717  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3225  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1528  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.837237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3825  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.18 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000788049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5119  enoyl-CoA hydratase  42.53 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2396  methylglutaconyl-CoA hydratase  38.8 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4586  enoyl-CoA hydratase  43.3 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  36.54 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1895  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.4 
 
 		 288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1670  methylglutaconyl-CoA hydratase  38.8 
 
 		 286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0889  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  40.41 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 276 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2324  methylglutaconyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2799  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 292 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1515  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.320841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2729  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  39.3 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1456  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1791  hypothetical protein  38.85 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2468  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.680829  normal  0.0128185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>