More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0109 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
259 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0102  enoyl-CoA hydratase  93.82 
 
 
259 aa  490  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0041  enoyl-CoA hydratase  68.9 
 
 
263 aa  342  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2206  enoyl-CoA hydratase  57.75 
 
 
259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0233003  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3258  enoyl-CoA hydratase  57.31 
 
 
259 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686991  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2437  enoyl-CoA hydratase  56.69 
 
 
259 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3199  enoyl-CoA hydratase  59.3 
 
 
259 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0460733  normal  0.284798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5736  enoyl-CoA hydratase  53.49 
 
 
259 aa  285  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112015  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 
255 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 
252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 
263 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.26 
 
 
264 aa  148  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4432  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 
275 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230876  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.08 
 
 
266 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.6 
 
 
264 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4387  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 
275 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0213556  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
266 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 
262 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 
262 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
264 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
264 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 
268 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
255 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 
255 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
260 aa  135  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0912  naphthoate synthase  35.16 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.092423  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 
262 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
287 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
262 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
266 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
260 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.98 
 
 
266 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
269 aa  132  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
266 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
263 aa  131  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
270 aa  131  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3297  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.62 
 
 
273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.6 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 
260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.08 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 
257 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
260 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 
257 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
265 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
264 aa  129  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
265 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.84 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.59 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2831  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
278 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
273 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.99 
 
 
262 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 
263 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
275 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
272 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
263 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>