More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1772 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 258 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.53 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  44.14 
 
 		 258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  42.29 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  40.87 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  42.32 
 
 		 269 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 		 264 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 		 290 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 		 290 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 		 265 aa  201  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  41.49 
 
 		 269 aa  198  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 		 264 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 264 aa  197  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 		 278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 		 266 aa  195  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.75 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 		 261 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.27 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  36.98 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.27 
 
 		 269 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 		 261 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 		 262 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 261 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.6 
 
 		 273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 		 269 aa  178  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  40.48 
 
 		 261 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 		 280 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 		 274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 		 263 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 		 276 aa  162  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 		 259 aa  161  8.000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.76 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.37 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.78 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.43 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.41 
 
 		 661 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.7 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.14 
 
 		 662 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  40.48 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  40.48 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.19 
 
 		 662 aa  152  7e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 		 273 aa  151  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 261 aa  151  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  31.52 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  31.52 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 		 251 aa  148  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>