More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1325 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
277 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  84.12 
 
 
274 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  70.8 
 
 
273 aa  380  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.03 
 
 
273 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  54.09 
 
 
275 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56 
 
 
263 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  53.31 
 
 
275 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  55.64 
 
 
270 aa  265  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  52.31 
 
 
273 aa  262  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  54.09 
 
 
266 aa  261  6e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  53.31 
 
 
275 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  54.94 
 
 
261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.14 
 
 
276 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.57 
 
 
275 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.82 
 
 
265 aa  248  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.58 
 
 
260 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.75 
 
 
260 aa  245  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 
275 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.18 
 
 
266 aa  241  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  49.42 
 
 
261 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  49.42 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  47.86 
 
 
261 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.79 
 
 
270 aa  236  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  48.06 
 
 
264 aa  236  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  48.45 
 
 
262 aa  236  4e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  45.76 
 
 
269 aa  236  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  48.83 
 
 
261 aa  234  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  48.83 
 
 
261 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  48.83 
 
 
261 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  54.09 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.41 
 
 
265 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 
264 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  46.39 
 
 
262 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.95 
 
 
274 aa  229  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 
264 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  48.05 
 
 
264 aa  228  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 
264 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 
290 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 
290 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  45.91 
 
 
264 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.6 
 
 
269 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  46.3 
 
 
278 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.3 
 
 
266 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  44.88 
 
 
264 aa  226  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 
269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  47.01 
 
 
269 aa  221  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  48.41 
 
 
269 aa  221  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.58 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 
272 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 
272 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46 
 
 
269 aa  218  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  47.22 
 
 
269 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.29 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  45.11 
 
 
266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  46.27 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  44.06 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.3 
 
 
262 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  44.8 
 
 
269 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.69 
 
 
270 aa  208  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  46.59 
 
 
267 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.91 
 
 
273 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.18 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  46.4 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.78 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  42.15 
 
 
272 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.76 
 
 
272 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.67 
 
 
261 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.77 
 
 
263 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.94 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.16 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.92 
 
 
258 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
258 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
263 aa  138  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
258 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 
256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.15 
 
 
255 aa  132  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  30.43 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 
266 aa  125  9e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
266 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 
265 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
264 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  32.4 
 
 
257 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.39 
 
 
257 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.39 
 
 
257 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3586  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.98 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.383471  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.39 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  31.68 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
258 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
263 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 
257 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>