More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4387 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4387  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
275 aa  558  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0213556  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4432  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.81 
 
 
275 aa  222  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230876  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5736  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
259 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112015  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2437  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
259 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 
270 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3258  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 
259 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686991  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.42 
 
 
260 aa  145  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.18 
 
 
264 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2206  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
259 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0233003  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 
259 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0102  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
259 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 
268 aa  138  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
264 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3199  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0460733  normal  0.284798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 
263 aa  132  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0041  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
263 aa  131  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
261 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
266 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
264 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4528  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0222933  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  36.69 
 
 
263 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  32.32 
 
 
264 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
269 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
269 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
269 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
271 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
263 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
255 aa  125  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 
255 aa  125  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 
261 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 
261 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 
261 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 
261 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
266 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 
261 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 
261 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 
261 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 
261 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4353  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
267 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 
261 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 
261 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.39 
 
 
253 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
264 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.74 
 
 
266 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 
265 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 
262 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 
261 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 
257 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 
261 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
264 aa  122  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
264 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
260 aa  122  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  31.91 
 
 
262 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
797 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
271 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.884728  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3586  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
262 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.383471  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 
275 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
261 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
261 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5034  enoyl-CoA hydratase  32.31 
 
 
261 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>