More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3088 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3088  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 262 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  81.25 
 
 		 256 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1140  enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.75 
 
 		 270 aa  322  5e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 		 367 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.7 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.31 
 
 		 662 aa  150  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.08 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.69 
 
 		 260 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35 
 
 		 662 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.34 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  36.99 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  38.82 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 		 258 aa  145  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.1 
 
 		 659 aa  143  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.05 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.2 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 		 268 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 		 258 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 		 262 aa  141  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 		 257 aa  141  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35 
 
 		 661 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.24 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.62 
 
 		 662 aa  138  7e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 		 257 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  29.8 
 
 		 257 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 		 265 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.17 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2206  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0233003  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0400  short chain enoyl-CoA hydratase  38.71 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0904838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>