More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05310 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  100 
 
 
261 aa  534  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
263 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 
263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 
263 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 
263 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  49.22 
 
 
262 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  49.62 
 
 
263 aa  254  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.64 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  49.42 
 
 
261 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  48.25 
 
 
260 aa  249  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  48.06 
 
 
263 aa  248  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  55.13 
 
 
263 aa  247  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  44.7 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  44.7 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  44.7 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  44.7 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  44.7 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  44.7 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  44.7 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 
263 aa  241  9e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  47.15 
 
 
263 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  51.02 
 
 
276 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  51.55 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 
280 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  44.74 
 
 
263 aa  231  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
264 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  45.74 
 
 
262 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  45.17 
 
 
261 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 
264 aa  228  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 
261 aa  227  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 
263 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 
259 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  46.9 
 
 
262 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  46.51 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  47.6 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  46.12 
 
 
262 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 
262 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  47.43 
 
 
263 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
270 aa  209  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  46.8 
 
 
263 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  45.69 
 
 
263 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  46.85 
 
 
263 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  46.56 
 
 
274 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  46 
 
 
263 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  45.85 
 
 
263 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  46 
 
 
263 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  46.95 
 
 
262 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.2 
 
 
259 aa  201  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
263 aa  201  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.09 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  45.42 
 
 
262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 
260 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 
262 aa  198  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  47.24 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.33 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  40.71 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42.15 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 
263 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  48.65 
 
 
261 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 
266 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
270 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
261 aa  188  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2188  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 
257 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  38.2 
 
 
266 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.65 
 
 
272 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 
261 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.77 
 
 
273 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.83 
 
 
267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.06 
 
 
260 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  43.77 
 
 
283 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.6 
 
 
260 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
262 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1797  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.47 
 
 
261 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
268 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.44 
 
 
256 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 
256 aa  175  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 
258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 
255 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.9 
 
 
258 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
268 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
266 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.61 
 
 
259 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 
267 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
266 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1985  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
266 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
258 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 
270 aa  168  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.048792  normal  0.959739 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
265 aa  167  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.47 
 
 
266 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>