More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2405 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 272 aa  534  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.07 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  65.81 
 
 		 266 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  55.97 
 
 		 264 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.6 
 
 		 260 aa  281  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  52.99 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  53.33 
 
 		 263 aa  271  7e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  54.34 
 
 		 280 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  53.18 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  53.7 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  53.18 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  53.18 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  53.18 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  54.05 
 
 		 263 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  53.18 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  53.18 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  53.18 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  52.21 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  51.47 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  51.47 
 
 		 263 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  54.31 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  54.14 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3942  enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.34 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908952  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  48.89 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  54.81 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  53.18 
 
 		 262 aa  248  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  51.84 
 
 		 263 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  52.81 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  57.25 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  52.81 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 		 276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  56.18 
 
 		 263 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  52.75 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 		 263 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  56.98 
 
 		 263 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  50.57 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  51.67 
 
 		 262 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  55.51 
 
 		 274 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  53.96 
 
 		 263 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  53.58 
 
 		 263 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  53.21 
 
 		 263 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  53.21 
 
 		 263 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  53.58 
 
 		 263 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  53.58 
 
 		 263 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.79 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  43.18 
 
 		 262 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  42.65 
 
 		 261 aa  225  6e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  49.07 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 		 261 aa  222  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  50.18 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  50.18 
 
 		 262 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  49.82 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  50.37 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.03 
 
 		 267 aa  201  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  43.96 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.92 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  44.02 
 
 		 263 aa  198  9e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  45.72 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  46.32 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  42.22 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.06 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  40.74 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  52.94 
 
 		 261 aa  188  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.08 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  40.74 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.78 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.06 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.28 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  49.26 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.65 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.32 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.85 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.63 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.38 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 		 265 aa  168  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.65 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.83 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.3 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.048792  normal  0.959739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  44.24 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0444  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.64 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.64 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.8 
 
 		 257 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1985  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  40.81 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.26 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4822  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.12 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.01 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1797  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.03 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  40.84 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.72 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>