More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2564 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
263 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
263 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  98.1 
 
 
263 aa  520  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  94.3 
 
 
263 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  92.78 
 
 
263 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  92.4 
 
 
263 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  90.87 
 
 
263 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  83.65 
 
 
263 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  80.61 
 
 
263 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  80.61 
 
 
263 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  80.61 
 
 
263 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  80.61 
 
 
263 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  80.61 
 
 
263 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  80.61 
 
 
263 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  80.61 
 
 
263 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  81.37 
 
 
263 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  80.23 
 
 
263 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  81.37 
 
 
263 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  74.49 
 
 
280 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  74.6 
 
 
274 aa  335  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  60.38 
 
 
263 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  59.77 
 
 
264 aa  310  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  60.38 
 
 
263 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  59.62 
 
 
263 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  60.24 
 
 
261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  57.36 
 
 
263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  59.85 
 
 
263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  65.35 
 
 
262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  64.96 
 
 
262 aa  305  6e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  64.96 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  56.98 
 
 
264 aa  298  9e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  60.8 
 
 
263 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  55.68 
 
 
263 aa  292  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  58.2 
 
 
276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  58.17 
 
 
262 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  57.77 
 
 
262 aa  268  8e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  54.55 
 
 
262 aa  266  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  57.77 
 
 
262 aa  265  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  57.77 
 
 
262 aa  265  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  51.17 
 
 
262 aa  265  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  55.2 
 
 
263 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  57.94 
 
 
263 aa  261  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  51.6 
 
 
260 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  52.03 
 
 
261 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  58.4 
 
 
263 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.2 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  47.35 
 
 
263 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  54.3 
 
 
262 aa  239  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  46 
 
 
261 aa  238  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  59.04 
 
 
261 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.21 
 
 
267 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  47.6 
 
 
261 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.62 
 
 
270 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 
259 aa  227  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 
266 aa  226  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.91 
 
 
267 aa  226  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.21 
 
 
272 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  46.42 
 
 
284 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.51 
 
 
260 aa  221  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  52.61 
 
 
263 aa  218  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 
258 aa  218  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
260 aa  216  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
266 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 
264 aa  214  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.13 
 
 
259 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  42.54 
 
 
266 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.37 
 
 
258 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.77 
 
 
256 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.15 
 
 
258 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  41.42 
 
 
266 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  42.34 
 
 
267 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 
258 aa  204  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.36 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.97 
 
 
264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 
266 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.46 
 
 
260 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.41 
 
 
270 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 
259 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.13 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.7 
 
 
264 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.53 
 
 
264 aa  183  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3942  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.52 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908952  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.56 
 
 
273 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0444  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
268 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.94 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.17 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
265 aa  170  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  40.94 
 
 
265 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
257 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.9 
 
 
255 aa  168  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
264 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2188  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
255 aa  168  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 
264 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
264 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.44 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.29 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>