More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3488 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  97.72 
 
 		 263 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  82.13 
 
 		 263 aa  447  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  82.13 
 
 		 263 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  82.13 
 
 		 263 aa  447  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  82.13 
 
 		 263 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  82.13 
 
 		 263 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  82.13 
 
 		 263 aa  447  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  82.13 
 
 		 263 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  80.99 
 
 		 263 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  89.73 
 
 		 263 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  83.65 
 
 		 263 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  82.51 
 
 		 263 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  81.37 
 
 		 263 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  82.51 
 
 		 263 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  81.37 
 
 		 263 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  82.13 
 
 		 263 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  81.37 
 
 		 263 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  78.54 
 
 		 280 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  79.12 
 
 		 274 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  70.08 
 
 		 262 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  69.69 
 
 		 262 aa  332  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  69.69 
 
 		 262 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  63.4 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  63.26 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  58.87 
 
 		 263 aa  311  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  58.87 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  60.75 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  60.75 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  61.02 
 
 		 261 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  62.86 
 
 		 276 aa  290  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  61.13 
 
 		 263 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 		 263 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  59.6 
 
 		 262 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 		 262 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  55.16 
 
 		 260 aa  270  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  59.2 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  59.2 
 
 		 262 aa  267  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  59.2 
 
 		 262 aa  267  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  52.78 
 
 		 262 aa  265  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  59.2 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  60.32 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  52.44 
 
 		 261 aa  249  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.89 
 
 		 267 aa  248  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.15 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  56 
 
 		 262 aa  245  6.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  47.24 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  62.45 
 
 		 261 aa  238  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  46.59 
 
 		 263 aa  238  9e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.6 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.47 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.4 
 
 		 270 aa  231  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  57.81 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.04 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  49.41 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  53.96 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  46.42 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.04 
 
 		 259 aa  218  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  48.29 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 		 264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  43.12 
 
 		 266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.91 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  48.68 
 
 		 258 aa  208  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  43.8 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  45.52 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.53 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  48.29 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.91 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  47.08 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  41.26 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.69 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.08 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.9 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.18 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3942  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.22 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908952  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.8 
 
 		 259 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.63 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.06 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.18 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.87 
 
 		 255 aa  178  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.79 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.37 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.46 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0444  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.67 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.41 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.87 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2188  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.18 
 
 		 255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.37 
 
 		 256 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4822  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.61 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>