More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3115 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 262 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  99.24 
 
 		 262 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  94.27 
 
 		 262 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  67.82 
 
 		 280 aa  357  9e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  66.41 
 
 		 263 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  66.41 
 
 		 263 aa  348  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  66.41 
 
 		 263 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  66.41 
 
 		 263 aa  348  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  66.41 
 
 		 263 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  66.41 
 
 		 263 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  66.41 
 
 		 263 aa  348  6e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  65.62 
 
 		 263 aa  347  9e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  68.75 
 
 		 263 aa  330  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  69.29 
 
 		 263 aa  330  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  69.69 
 
 		 263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  68.97 
 
 		 274 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  66.14 
 
 		 263 aa  308  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  66.54 
 
 		 263 aa  308  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  66.93 
 
 		 263 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  65.75 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  65.78 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  64.96 
 
 		 263 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  64.96 
 
 		 263 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  58.94 
 
 		 263 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  58.94 
 
 		 263 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  57.94 
 
 		 264 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  58.17 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 		 264 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  58.2 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  57.03 
 
 		 263 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  57.25 
 
 		 263 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  56.59 
 
 		 276 aa  275  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  52.27 
 
 		 263 aa  269  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  53.99 
 
 		 263 aa  261  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  53.85 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  56.06 
 
 		 263 aa  254  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  51.35 
 
 		 260 aa  248  7e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  51.91 
 
 		 262 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  50.19 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  56.76 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  56.37 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  56.37 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  55.34 
 
 		 263 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  46.18 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  50 
 
 		 261 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  48.65 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  52.31 
 
 		 262 aa  225  7e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.29 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  56.98 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 		 263 aa  218  8.999999999999998e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.08 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  52.08 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  43.66 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.34 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  53.23 
 
 		 263 aa  205  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.34 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  42.54 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.08 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  47.18 
 
 		 259 aa  201  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.15 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  44.93 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  48.28 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  44.11 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.08 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  46.36 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.74 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.42 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.95 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.59 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  43.07 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.06 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.09 
 
 		 260 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.35 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.02 
 
 		 258 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.98 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4070  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4145  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3942  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.01 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908952  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4299  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 272 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 		 278 aa  165  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.88 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0444  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.15 
 
 		 268 aa  161  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  45.85 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4241  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2188  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.78 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1797  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.56 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 260 aa  154  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  42.86 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0126218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>