More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001548 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  100 
 
 
261 aa  530  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  87.94 
 
 
262 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  70.23 
 
 
263 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  72.55 
 
 
257 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1528  enoyl-CoA hydratase  71.88 
 
 
257 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2853  enoyl-CoA hydratase  71.88 
 
 
257 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000407618 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1498  enoyl-CoA hydratase  71.88 
 
 
257 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1492  enoyl-CoA hydratase  71.88 
 
 
257 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  71.54 
 
 
257 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1400  enoyl-CoA hydratase  70.31 
 
 
257 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1940  enoyl-CoA hydratase  72.4 
 
 
260 aa  359  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2594  enoyl-CoA hydratase  72.27 
 
 
257 aa  357  7e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000334724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2661  enoyl-CoA hydratase  72.27 
 
 
257 aa  358  7e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173157  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2768  enoyl-CoA hydratase  72.27 
 
 
257 aa  357  7e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.309342 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  69.51 
 
 
258 aa  357  8e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1476  enoyl-CoA hydratase  70.75 
 
 
257 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0195033 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1680  enoyl-CoA hydratase  73.2 
 
 
257 aa  355  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1378  enoyl-CoA hydratase  72.4 
 
 
257 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1341  enoyl-CoA hydratase  68.5 
 
 
260 aa  347  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  66.8 
 
 
260 aa  346  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  64.98 
 
 
259 aa  338  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  65.34 
 
 
260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0221  enoyl-CoA hydratase  65.85 
 
 
265 aa  327  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.919507  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2473  enoyl-CoA hydratase  64.59 
 
 
262 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0123769 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  63.71 
 
 
265 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0657  enoyl-CoA hydratase  61.79 
 
 
258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1515  enoyl-CoA hydratase  63.75 
 
 
260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  63.97 
 
 
272 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  63.97 
 
 
303 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4775  enoyl-CoA hydratase  63.01 
 
 
272 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54640  enoyl-CoA hydratase  63.01 
 
 
272 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194737  hitchhiker  0.0000224926 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 
256 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  58.61 
 
 
268 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  56.73 
 
 
263 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  57.55 
 
 
272 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  56.68 
 
 
262 aa  261  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  55.69 
 
 
263 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  55.92 
 
 
268 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_003296  RS05574  enoyl-CoA hydratase  55.28 
 
 
266 aa  249  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.116145 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4090  enoyl-CoA hydratase  55.24 
 
 
265 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3977  enoyl-CoA hydratase  55.24 
 
 
265 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4900  enoyl-CoA hydratase  56.5 
 
 
263 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5327  enoyl-CoA hydratase  56.5 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0280176  normal  0.0376656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3408  enoyl-CoA hydratase  56.5 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4959  enoyl-CoA hydratase  56.5 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4381  enoyl-CoA hydratase  56.5 
 
 
263 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3572  enoyl-CoA hydratase  55.28 
 
 
259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0922  enoyl-CoA hydratase  53.66 
 
 
264 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2182  enoyl-CoA hydratase  53.66 
 
 
264 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0830  enoyl-CoA hydratase  53.66 
 
 
264 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831593  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1799  enoyl-CoA hydratase  53.06 
 
 
264 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  41.37 
 
 
263 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  40.87 
 
 
263 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  40.87 
 
 
263 aa  185  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  40.87 
 
 
263 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  40.87 
 
 
263 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.38 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 
261 aa  178  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  40.96 
 
 
257 aa  178  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 
263 aa  174  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 
263 aa  174  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
267 aa  172  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 
258 aa  171  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 
262 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.29 
 
 
260 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
257 aa  168  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.29 
 
 
260 aa  168  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.19 
 
 
258 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 
265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  39.6 
 
 
258 aa  165  8e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  42.25 
 
 
258 aa  165  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  38.96 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 
262 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 
258 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 
262 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 
258 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.2 
 
 
260 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  37.45 
 
 
283 aa  161  8.000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 
262 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
259 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
268 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  37.85 
 
 
260 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
255 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
258 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 
262 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.31 
 
 
255 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
258 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
257 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.4 
 
 
255 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 
262 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.31 
 
 
255 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
258 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
258 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>