More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1940 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1940  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1492  enoyl-CoA hydratase  86.22 
 
 		 257 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1498  enoyl-CoA hydratase  86.22 
 
 		 257 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1528  enoyl-CoA hydratase  86.22 
 
 		 257 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1400  enoyl-CoA hydratase  85.43 
 
 		 257 aa  447  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  85.88 
 
 		 257 aa  448  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2853  enoyl-CoA hydratase  85.83 
 
 		 257 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000407618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  83.2 
 
 		 257 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2768  enoyl-CoA hydratase  87.4 
 
 		 257 aa  435  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2594  enoyl-CoA hydratase  87.4 
 
 		 257 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000334724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2661  enoyl-CoA hydratase  87.8 
 
 		 257 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1378  enoyl-CoA hydratase  88.58 
 
 		 257 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1680  enoyl-CoA hydratase  87.01 
 
 		 257 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1476  enoyl-CoA hydratase  86.27 
 
 		 257 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1341  enoyl-CoA hydratase  83.4 
 
 		 260 aa  428  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  79.07 
 
 		 263 aa  424  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  71.15 
 
 		 262 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  72.4 
 
 		 261 aa  374  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  71.54 
 
 		 260 aa  374  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  68.85 
 
 		 260 aa  368  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  72.59 
 
 		 258 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  71.49 
 
 		 259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1515  enoyl-CoA hydratase  70.38 
 
 		 260 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  68.77 
 
 		 265 aa  350  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2473  enoyl-CoA hydratase  70.68 
 
 		 262 aa  349  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0123769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  67.87 
 
 		 272 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  67.87 
 
 		 303 aa  340  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0221  enoyl-CoA hydratase  69.35 
 
 		 265 aa  340  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.919507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54640  enoyl-CoA hydratase  66.53 
 
 		 272 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194737  hitchhiker  0.0000224926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4775  enoyl-CoA hydratase  66.53 
 
 		 272 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0657  enoyl-CoA hydratase  63.56 
 
 		 258 aa  315  7e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  60.8 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  63.45 
 
 		 263 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  63.31 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  61.29 
 
 		 272 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  60.32 
 
 		 268 aa  288  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4959  enoyl-CoA hydratase  63.86 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3408  enoyl-CoA hydratase  63.86 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5327  enoyl-CoA hydratase  63.86 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0280176  normal  0.0376656 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  60.08 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4900  enoyl-CoA hydratase  63.05 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4381  enoyl-CoA hydratase  63.05 
 
 		 263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  58.24 
 
 		 262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4090  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3977  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05574  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 		 266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.116145 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0830  enoyl-CoA hydratase  58.23 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2182  enoyl-CoA hydratase  58.23 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0922  enoyl-CoA hydratase  58.23 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1799  enoyl-CoA hydratase  57.66 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3572  enoyl-CoA hydratase  55.24 
 
 		 259 aa  245  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.3 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.91 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.86 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.26 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.72 
 
 		 258 aa  165  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  39.08 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 258 aa  165  8e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 		 260 aa  164  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.34 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  37.75 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.61 
 
 		 260 aa  162  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.85 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  40.39 
 
 		 253 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 		 259 aa  161  9e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  39.38 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  39 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  39 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 		 268 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.25 
 
 		 259 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  38.52 
 
 		 663 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>