More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0248 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
262 aa  524  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  84.11 
 
 
272 aa  434  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  83.33 
 
 
268 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4090  enoyl-CoA hydratase  82.95 
 
 
265 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  80.39 
 
 
268 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3977  enoyl-CoA hydratase  82.95 
 
 
265 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05574  enoyl-CoA hydratase  83.66 
 
 
266 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.116145 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  76.71 
 
 
256 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  72.37 
 
 
263 aa  370  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3572  enoyl-CoA hydratase  77.13 
 
 
259 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  72.27 
 
 
263 aa  362  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2182  enoyl-CoA hydratase  68.87 
 
 
264 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0830  enoyl-CoA hydratase  68.87 
 
 
264 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831593  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0922  enoyl-CoA hydratase  68.87 
 
 
264 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1799  enoyl-CoA hydratase  69.53 
 
 
264 aa  350  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3408  enoyl-CoA hydratase  73.15 
 
 
263 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4959  enoyl-CoA hydratase  73.15 
 
 
263 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5327  enoyl-CoA hydratase  73.15 
 
 
263 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0280176  normal  0.0376656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4381  enoyl-CoA hydratase  73.15 
 
 
263 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4900  enoyl-CoA hydratase  72.37 
 
 
263 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  64.45 
 
 
265 aa  311  7.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  61.39 
 
 
260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  64.52 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4775  enoyl-CoA hydratase  64.11 
 
 
272 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54640  enoyl-CoA hydratase  64.11 
 
 
272 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194737  hitchhiker  0.0000224926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  57.92 
 
 
259 aa  298  8e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2473  enoyl-CoA hydratase  64.11 
 
 
262 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0123769 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 
260 aa  292  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  61.29 
 
 
257 aa  292  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  61.69 
 
 
303 aa  288  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  60.24 
 
 
257 aa  288  7e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1341  enoyl-CoA hydratase  62.9 
 
 
260 aa  287  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  59.68 
 
 
263 aa  286  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0221  enoyl-CoA hydratase  61.04 
 
 
265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.919507  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1515  enoyl-CoA hydratase  61.04 
 
 
260 aa  281  6.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1378  enoyl-CoA hydratase  60.24 
 
 
257 aa  279  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1940  enoyl-CoA hydratase  58.24 
 
 
260 aa  279  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  56.87 
 
 
258 aa  277  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1400  enoyl-CoA hydratase  57.48 
 
 
257 aa  275  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0657  enoyl-CoA hydratase  52.51 
 
 
258 aa  275  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1528  enoyl-CoA hydratase  57.87 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2853  enoyl-CoA hydratase  57.87 
 
 
257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000407618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1492  enoyl-CoA hydratase  57.87 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1498  enoyl-CoA hydratase  57.87 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  57.83 
 
 
262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1476  enoyl-CoA hydratase  59.45 
 
 
257 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0195033 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  56.68 
 
 
261 aa  268  8e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2661  enoyl-CoA hydratase  59.06 
 
 
257 aa  265  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173157  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2594  enoyl-CoA hydratase  58.66 
 
 
257 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000334724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2768  enoyl-CoA hydratase  58.66 
 
 
257 aa  265  7e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.309342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1680  enoyl-CoA hydratase  58.27 
 
 
257 aa  263  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
263 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
263 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
263 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
263 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
263 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.2 
 
 
260 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.8 
 
 
260 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.8 
 
 
260 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
260 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
262 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
260 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.52 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
262 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  43.27 
 
 
260 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.87 
 
 
268 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.25 
 
 
258 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
257 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  39.46 
 
 
258 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.6 
 
 
257 aa  160  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 
258 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.32 
 
 
260 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 
261 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 
259 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 
257 aa  158  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  38.02 
 
 
283 aa  157  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 
258 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.93 
 
 
260 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
260 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
259 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  42.11 
 
 
663 aa  156  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2897  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.34 
 
 
271 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 
260 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 
262 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.8 
 
 
258 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40.16 
 
 
257 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.46 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  42.04 
 
 
260 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 
260 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
265 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.71 
 
 
659 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 
259 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
260 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
259 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
262 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
258 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>