More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3977 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3977  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 265 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4090  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 265 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_003296  RS05574  enoyl-CoA hydratase  87.4 
 
 		 266 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.116145 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  84.56 
 
 		 268 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  82.89 
 
 		 272 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  81.57 
 
 		 268 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  82.95 
 
 		 262 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  74.62 
 
 		 263 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  72.52 
 
 		 263 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3572  enoyl-CoA hydratase  77.39 
 
 		 259 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  70.43 
 
 		 256 aa  360  9e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0830  enoyl-CoA hydratase  68.56 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2182  enoyl-CoA hydratase  68.56 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0922  enoyl-CoA hydratase  68.56 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5327  enoyl-CoA hydratase  74.43 
 
 		 263 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0280176  normal  0.0376656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3408  enoyl-CoA hydratase  74.43 
 
 		 263 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4959  enoyl-CoA hydratase  74.43 
 
 		 263 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4381  enoyl-CoA hydratase  73.66 
 
 		 263 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1799  enoyl-CoA hydratase  68.18 
 
 		 264 aa  354  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4900  enoyl-CoA hydratase  73.28 
 
 		 263 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  64.63 
 
 		 260 aa  305  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  64.4 
 
 		 272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4775  enoyl-CoA hydratase  64 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  59.14 
 
 		 259 aa  295  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54640  enoyl-CoA hydratase  63.6 
 
 		 272 aa  295  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194737  hitchhiker  0.0000224926 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  62.11 
 
 		 265 aa  292  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  62.4 
 
 		 303 aa  287  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  62.04 
 
 		 260 aa  284  8e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2473  enoyl-CoA hydratase  63.67 
 
 		 262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0123769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  60.82 
 
 		 257 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  60.82 
 
 		 257 aa  281  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1515  enoyl-CoA hydratase  62.04 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1492  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1528  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2853  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000407618 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1400  enoyl-CoA hydratase  59.18 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1498  enoyl-CoA hydratase  60.41 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1341  enoyl-CoA hydratase  60.82 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0221  enoyl-CoA hydratase  60.41 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.919507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1940  enoyl-CoA hydratase  59.76 
 
 		 260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0657  enoyl-CoA hydratase  53.85 
 
 		 258 aa  268  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1378  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 		 257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  56.73 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  56.68 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1476  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195033 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2594  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 		 257 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000334724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2768  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 		 257 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2661  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1680  enoyl-CoA hydratase  59.59 
 
 		 257 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  57.66 
 
 		 262 aa  258  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  55.24 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.04 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.65 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  40.7 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2897  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.91 
 
 		 260 aa  155  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.66 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.2 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.15 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.7 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42 
 
 		 258 aa  148  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  36.55 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.2 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.78 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 		 260 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.77 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  40.73 
 
 		 663 aa  145  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.53 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  38.84 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  38.84 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.22 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  38.84 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  38.39 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>