More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1374 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 272 aa  556  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4775  enoyl-CoA hydratase  92.25 
 
 		 272 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54640  enoyl-CoA hydratase  92.62 
 
 		 272 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194737  hitchhiker  0.0000224926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  85.66 
 
 		 303 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  69.02 
 
 		 260 aa  355  5e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  69.8 
 
 		 260 aa  350  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2473  enoyl-CoA hydratase  71.15 
 
 		 262 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0123769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1400  enoyl-CoA hydratase  68.27 
 
 		 257 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  64.23 
 
 		 259 aa  338  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  67.74 
 
 		 257 aa  338  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1498  enoyl-CoA hydratase  67.47 
 
 		 257 aa  338  5e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1528  enoyl-CoA hydratase  67.47 
 
 		 257 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1492  enoyl-CoA hydratase  67.47 
 
 		 257 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2853  enoyl-CoA hydratase  67.47 
 
 		 257 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000407618 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  65.77 
 
 		 263 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1515  enoyl-CoA hydratase  69.8 
 
 		 260 aa  335  5e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1341  enoyl-CoA hydratase  67.57 
 
 		 260 aa  333  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  64.82 
 
 		 265 aa  331  9e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1378  enoyl-CoA hydratase  69.08 
 
 		 257 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1940  enoyl-CoA hydratase  67.87 
 
 		 260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  65.32 
 
 		 257 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  62.02 
 
 		 258 aa  322  5e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0221  enoyl-CoA hydratase  67.59 
 
 		 265 aa  321  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.919507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2768  enoyl-CoA hydratase  67.07 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2594  enoyl-CoA hydratase  67.07 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000334724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2661  enoyl-CoA hydratase  67.07 
 
 		 257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  63.97 
 
 		 261 aa  319  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1680  enoyl-CoA hydratase  66.67 
 
 		 257 aa  318  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  64.37 
 
 		 262 aa  318  7e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  67.21 
 
 		 263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1476  enoyl-CoA hydratase  65.32 
 
 		 257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  64.17 
 
 		 272 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  64.82 
 
 		 268 aa  308  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  63.78 
 
 		 268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  65.85 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2182  enoyl-CoA hydratase  63.92 
 
 		 264 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0922  enoyl-CoA hydratase  63.92 
 
 		 264 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0830  enoyl-CoA hydratase  63.92 
 
 		 264 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831593  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1799  enoyl-CoA hydratase  64.96 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  62.1 
 
 		 256 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0657  enoyl-CoA hydratase  56.98 
 
 		 258 aa  298  8e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05574  enoyl-CoA hydratase  66.53 
 
 		 266 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.116145 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  64.52 
 
 		 262 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3977  enoyl-CoA hydratase  64.4 
 
 		 265 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4090  enoyl-CoA hydratase  64.4 
 
 		 265 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4900  enoyl-CoA hydratase  66.53 
 
 		 263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3408  enoyl-CoA hydratase  66.53 
 
 		 263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5327  enoyl-CoA hydratase  66.53 
 
 		 263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0280176  normal  0.0376656 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4959  enoyl-CoA hydratase  66.53 
 
 		 263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4381  enoyl-CoA hydratase  66.13 
 
 		 263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3572  enoyl-CoA hydratase  59.3 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.74 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.74 
 
 		 260 aa  185  9e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.99 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 260 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.1 
 
 		 659 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.98 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.92 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.35 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 		 367 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.35 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.02 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.45 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.41 
 
 		 260 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.36 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>