More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1670 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 257 aa  520  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  85.94 
 
 		 257 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1498  enoyl-CoA hydratase  84.05 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1492  enoyl-CoA hydratase  84.05 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1528  enoyl-CoA hydratase  84.05 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1400  enoyl-CoA hydratase  83.27 
 
 		 257 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2853  enoyl-CoA hydratase  83.66 
 
 		 257 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000407618 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  82.07 
 
 		 263 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2768  enoyl-CoA hydratase  84.44 
 
 		 257 aa  427  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1476  enoyl-CoA hydratase  83.2 
 
 		 257 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195033 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2594  enoyl-CoA hydratase  84.44 
 
 		 257 aa  427  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000334724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2661  enoyl-CoA hydratase  84.82 
 
 		 257 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1680  enoyl-CoA hydratase  84.05 
 
 		 257 aa  425  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1940  enoyl-CoA hydratase  83.2 
 
 		 260 aa  421  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1378  enoyl-CoA hydratase  83.27 
 
 		 257 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1341  enoyl-CoA hydratase  80.31 
 
 		 260 aa  407  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  74.12 
 
 		 262 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  74.1 
 
 		 260 aa  377  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  72.55 
 
 		 261 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  72.4 
 
 		 260 aa  362  3e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  71.14 
 
 		 258 aa  354  7.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  69.35 
 
 		 259 aa  348  6e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1515  enoyl-CoA hydratase  72 
 
 		 260 aa  344  7e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2473  enoyl-CoA hydratase  69.2 
 
 		 262 aa  340  9e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0123769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  67.74 
 
 		 272 aa  338  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  67.34 
 
 		 265 aa  334  7.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  66.94 
 
 		 303 aa  332  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54640  enoyl-CoA hydratase  67.21 
 
 		 272 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194737  hitchhiker  0.0000224926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4775  enoyl-CoA hydratase  67.21 
 
 		 272 aa  328  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0221  enoyl-CoA hydratase  67.21 
 
 		 265 aa  326  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.919507  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0657  enoyl-CoA hydratase  61.13 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  60.48 
 
 		 256 aa  298  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  61.38 
 
 		 268 aa  290  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  61.13 
 
 		 272 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  61.54 
 
 		 263 aa  288  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  60.08 
 
 		 263 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  59.51 
 
 		 268 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  61.29 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3977  enoyl-CoA hydratase  60.82 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4090  enoyl-CoA hydratase  60.82 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4900  enoyl-CoA hydratase  60.08 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5327  enoyl-CoA hydratase  60.48 
 
 		 263 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0280176  normal  0.0376656 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4959  enoyl-CoA hydratase  60.48 
 
 		 263 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3408  enoyl-CoA hydratase  60.48 
 
 		 263 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4381  enoyl-CoA hydratase  60.89 
 
 		 263 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0922  enoyl-CoA hydratase  58.06 
 
 		 264 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2182  enoyl-CoA hydratase  58.06 
 
 		 264 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0830  enoyl-CoA hydratase  58.06 
 
 		 264 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831593  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05574  enoyl-CoA hydratase  58.87 
 
 		 266 aa  264  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.116145 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1799  enoyl-CoA hydratase  57.89 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3572  enoyl-CoA hydratase  56.05 
 
 		 259 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.56 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.16 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.55 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.02 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.4 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.42 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  36.69 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40.08 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40.08 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.2 
 
 		 260 aa  158  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40.08 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.57 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.57 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.03 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  34.59 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 262 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.03 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  35.08 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.74 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  35.08 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>