More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0657 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0657  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
258 aa  530  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  59.85 
 
 
259 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  61.79 
 
 
261 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  58.53 
 
 
258 aa  315  6e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  60.63 
 
 
263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  60.16 
 
 
262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  61.94 
 
 
257 aa  308  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0221  enoyl-CoA hydratase  60.47 
 
 
265 aa  308  5.9999999999999995e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.919507  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  59.46 
 
 
260 aa  307  8e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  61.13 
 
 
257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  59.68 
 
 
260 aa  304  8.000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1476  enoyl-CoA hydratase  62.75 
 
 
257 aa  300  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0195033 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  57.09 
 
 
265 aa  300  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2473  enoyl-CoA hydratase  58.89 
 
 
262 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0123769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1400  enoyl-CoA hydratase  61.13 
 
 
257 aa  298  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  56.98 
 
 
272 aa  298  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1940  enoyl-CoA hydratase  63.56 
 
 
260 aa  297  9e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2853  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 
257 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000407618 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1498  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 
257 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1528  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 
257 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1492  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 
257 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1341  enoyl-CoA hydratase  61.94 
 
 
260 aa  295  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1515  enoyl-CoA hydratase  59.68 
 
 
260 aa  291  8e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  56.2 
 
 
303 aa  288  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2661  enoyl-CoA hydratase  61.13 
 
 
257 aa  288  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173157  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4775  enoyl-CoA hydratase  56.42 
 
 
272 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54640  enoyl-CoA hydratase  56.42 
 
 
272 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194737  hitchhiker  0.0000224926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2768  enoyl-CoA hydratase  61.13 
 
 
257 aa  288  8e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.309342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2594  enoyl-CoA hydratase  61.13 
 
 
257 aa  288  8e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000334724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1378  enoyl-CoA hydratase  62.35 
 
 
257 aa  287  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1680  enoyl-CoA hydratase  59.61 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  55.24 
 
 
256 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  55.06 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  52.51 
 
 
262 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  53.01 
 
 
263 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4090  enoyl-CoA hydratase  53.85 
 
 
265 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  52.85 
 
 
268 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3977  enoyl-CoA hydratase  53.85 
 
 
265 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  52.23 
 
 
272 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  52.23 
 
 
268 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_003296  RS05574  enoyl-CoA hydratase  53.63 
 
 
266 aa  258  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.116145 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4900  enoyl-CoA hydratase  53.41 
 
 
263 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5327  enoyl-CoA hydratase  53.01 
 
 
263 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0280176  normal  0.0376656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3408  enoyl-CoA hydratase  53.01 
 
 
263 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4959  enoyl-CoA hydratase  53.01 
 
 
263 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4381  enoyl-CoA hydratase  53.01 
 
 
263 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0830  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
264 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2182  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
264 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0922  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
264 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1799  enoyl-CoA hydratase  50.6 
 
 
264 aa  244  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3572  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
259 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.04 
 
 
260 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.65 
 
 
260 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 
261 aa  168  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.27 
 
 
258 aa  161  9e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 
263 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 
263 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 
263 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 
263 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.55 
 
 
260 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
260 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
259 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
259 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
257 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.14 
 
 
267 aa  155  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
259 aa  155  9e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 
257 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 
262 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.52 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.52 
 
 
255 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.27 
 
 
255 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
261 aa  151  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
257 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
257 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
257 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
260 aa  149  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.8 
 
 
260 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
258 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
258 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 
268 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
267 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 
258 aa  149  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.66 
 
 
260 aa  149  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  36.69 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
263 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
263 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
260 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
258 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
258 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
258 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.96 
 
 
659 aa  145  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 
264 aa  145  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
257 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>