More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5130 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
268 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  86.89 
 
 
272 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  87.74 
 
 
268 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3977  enoyl-CoA hydratase  79.25 
 
 
265 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4090  enoyl-CoA hydratase  79.25 
 
 
265 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  79.84 
 
 
262 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05574  enoyl-CoA hydratase  79.77 
 
 
266 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.116145 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  73.28 
 
 
263 aa  377  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3572  enoyl-CoA hydratase  76.74 
 
 
259 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  74.61 
 
 
263 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  68.9 
 
 
256 aa  362  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5327  enoyl-CoA hydratase  74.43 
 
 
263 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0280176  normal  0.0376656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3408  enoyl-CoA hydratase  74.43 
 
 
263 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4959  enoyl-CoA hydratase  74.43 
 
 
263 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4900  enoyl-CoA hydratase  73.66 
 
 
263 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4381  enoyl-CoA hydratase  74.05 
 
 
263 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0830  enoyl-CoA hydratase  67.18 
 
 
264 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2182  enoyl-CoA hydratase  67.18 
 
 
264 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0922  enoyl-CoA hydratase  67.18 
 
 
264 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1799  enoyl-CoA hydratase  68.75 
 
 
264 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  66.02 
 
 
260 aa  322  6e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  64.31 
 
 
272 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4775  enoyl-CoA hydratase  63.14 
 
 
272 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  62.5 
 
 
260 aa  300  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54640  enoyl-CoA hydratase  62.75 
 
 
272 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194737  hitchhiker  0.0000224926 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  60.94 
 
 
265 aa  299  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1515  enoyl-CoA hydratase  62.11 
 
 
260 aa  291  5e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  60.89 
 
 
257 aa  291  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  60.78 
 
 
303 aa  291  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 
257 aa  287  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  58.13 
 
 
259 aa  285  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0221  enoyl-CoA hydratase  60.24 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.919507  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1378  enoyl-CoA hydratase  62.25 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1341  enoyl-CoA hydratase  61.69 
 
 
260 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1498  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 
257 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1528  enoyl-CoA hydratase  59.44 
 
 
257 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1492  enoyl-CoA hydratase  59.44 
 
 
257 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1400  enoyl-CoA hydratase  58.63 
 
 
257 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2853  enoyl-CoA hydratase  59.44 
 
 
257 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000407618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2473  enoyl-CoA hydratase  60.69 
 
 
262 aa  279  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0123769 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  57.87 
 
 
262 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  56.85 
 
 
263 aa  275  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1940  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2594  enoyl-CoA hydratase  60.24 
 
 
257 aa  271  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000334724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2768  enoyl-CoA hydratase  60.24 
 
 
257 aa  271  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.309342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2661  enoyl-CoA hydratase  60.24 
 
 
257 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173157  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1680  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 
257 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1476  enoyl-CoA hydratase  58.37 
 
 
257 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0195033 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  53.91 
 
 
258 aa  269  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  58.13 
 
 
261 aa  268  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0657  enoyl-CoA hydratase  52.21 
 
 
258 aa  262  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  40.87 
 
 
258 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.15 
 
 
260 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.76 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  40.71 
 
 
258 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 
263 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 
263 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 
263 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 
263 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 
263 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 
260 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.74 
 
 
260 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
262 aa  158  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
260 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 
258 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 
262 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 
260 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.63 
 
 
258 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
263 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
263 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.38 
 
 
260 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.4 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
262 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.47 
 
 
258 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
262 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
262 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  39.68 
 
 
283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
262 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
262 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 
259 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 
259 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
262 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
262 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
262 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
262 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  42.52 
 
 
265 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
260 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.95 
 
 
260 aa  149  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.59 
 
 
260 aa  149  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  39.11 
 
 
659 aa  148  9e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  40.65 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.91 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  42.04 
 
 
253 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 
263 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 
261 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>