More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2936 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 262 aa  521  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.95 
 
 		 262 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  65.27 
 
 		 288 aa  335  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6065  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.41 
 
 		 259 aa  327  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.638371  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  62.84 
 
 		 268 aa  325  6e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.07 
 
 		 259 aa  322  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  64.89 
 
 		 259 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  59.54 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  58.4 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.92 
 
 		 257 aa  292  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.92 
 
 		 257 aa  289  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.16 
 
 		 257 aa  289  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60 
 
 		 261 aa  281  9e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.87 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.63 
 
 		 257 aa  274  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0682  short chain enoyl-CoA hydratase  58.3 
 
 		 285 aa  271  9e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.11 
 
 		 257 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3662  short chain enoyl-CoA hydratase  57.66 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.745999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1071  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.53 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.62 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13055  enoyl-CoA hydratase  46.67 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.12281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1839  enoyl-CoA hydratase  52.17 
 
 		 216 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.952536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1905  enoyl-CoA hydratase  52.17 
 
 		 216 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.888285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.17 
 
 		 216 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53207  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  45.85 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  45.85 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  46.44 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  46.89 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  46.89 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  46.89 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  45.64 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  46.22 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.02 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.37 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.44 
 
 		 259 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.05 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  45.8 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  46.22 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.2 
 
 		 259 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.05 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  43.7 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  44.76 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.26 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.15 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2089  enoyl-CoA hydratase  49.53 
 
 		 225 aa  189  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.54 
 
 		 259 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4270  enoyl-CoA hydratase  51.94 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.19 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.1 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.42 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.31 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  44.12 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.55 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  45.11 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.93 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.9 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  43.03 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  41.7 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.77 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.25 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 		 260 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.11 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  40.65 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.9 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.84 
 
 		 258 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.52 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.16 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.74 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  43.44 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.29 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5078  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.1 
 
 		 262 aa  178  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.43 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  42.57 
 
 		 275 aa  178  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 		 260 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.1 
 
 		 260 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  43.33 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.44 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  41.91 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  41.91 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  41.91 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  41.91 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  42.92 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.4 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.92 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>