More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1746 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1746  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
261 aa  512  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 
257 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
257 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.74 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
257 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
258 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
258 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
266 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3088  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
264 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
256 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  36.69 
 
 
257 aa  125  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
259 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.08 
 
 
257 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
251 aa  124  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 
259 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
262 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
259 aa  123  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
258 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  34.41 
 
 
261 aa  123  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
257 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 
264 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.55 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.98 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
260 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
259 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.13 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
257 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
259 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 
257 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
259 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
290 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
290 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  33.99 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.51 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.73 
 
 
662 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 
258 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
259 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
258 aa  116  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 
257 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2905  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.433912  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3631  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251765  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6084  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
258 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 
278 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
260 aa  113  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.85 
 
 
278 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 
259 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.45 
 
 
266 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.98 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
256 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 
267 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.62 
 
 
659 aa  112  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.36 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
258 aa  111  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  32.02 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.5 
 
 
661 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
277 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
266 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 
257 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 
258 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>