More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0385 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0385  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 243 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.61 
 
 		 245 aa  269  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.44 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  45.37 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  45.37 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1533  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.789962  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1871  enoyl-CoA hydratase  45.87 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4495  enoyl-CoA hydratase  44.89 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12846  enoyl-CoA hydratase  48.02 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.59 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2134  enoyl-CoA hydratase  42.19 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0100936 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2071  enoyl-CoA hydratase  42.19 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0296797  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2088  enoyl-CoA hydratase  42.19 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109638  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2320  enoyl-CoA hydratase  44.33 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0702253  normal  0.0764248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4034  enoyl-CoA hydratase  43.84 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0345  enoyl-CoA hydratase  44.39 
 
 		 277 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.918373  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  41.48 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  39.19 
 
 		 259 aa  144  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.45 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  40.51 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  38.32 
 
 		 258 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.02 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4139  enoyl-CoA hydratase  46.46 
 
 		 265 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  38.36 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.44 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  38.32 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0566  enoyl-CoA hydratase  37.34 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.95 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  37.38 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.68 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.81 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  38.32 
 
 		 258 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  37.44 
 
 		 259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.05 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  36.75 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.28 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.2 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.09 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.38 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  37.71 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.81 
 
 		 267 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 		 258 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  40.09 
 
 		 270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.55 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  39.72 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  38.86 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.33 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.49 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.97 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 		 256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  37.09 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  38.79 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.78 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.56 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.86 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.33 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.86 
 
 		 260 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.9 
 
 		 255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 		 257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.49 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0876  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.1 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.04 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  40.38 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.44 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.53 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  36.24 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.44 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.49 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  41.74 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.28 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.45 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  38.36 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.04 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.6 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.6 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.6 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  38.36 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  38.32 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.21 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  38.86 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>