More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4139 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4139  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
265 aa  510  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.96 
 
 
253 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4034  enoyl-CoA hydratase  45.7 
 
 
270 aa  201  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2320  enoyl-CoA hydratase  44.79 
 
 
270 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0702253  normal  0.0764248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2134  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0100936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2088  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2071  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0296797  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  46.04 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12846  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 
249 aa  188  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000117946  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0345  enoyl-CoA hydratase  44.89 
 
 
277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.918373  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0566  enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 
263 aa  178  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.8 
 
 
237 aa  176  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  51.22 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  51.22 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1533  enoyl-CoA hydratase  50.73 
 
 
257 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.789962  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.04 
 
 
245 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4495  enoyl-CoA hydratase  50.76 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166279  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1871  enoyl-CoA hydratase  49.52 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0385  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.97 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  42.51 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.1 
 
 
261 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.28 
 
 
260 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.53 
 
 
264 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.17 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.36 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.44 
 
 
259 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.53 
 
 
260 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  39.63 
 
 
260 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.66 
 
 
268 aa  128  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 
256 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  36.67 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  39.19 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  37.67 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.51 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 
258 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.07 
 
 
260 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 
258 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  38.21 
 
 
265 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  40.25 
 
 
267 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 
262 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.68 
 
 
261 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
262 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0876  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
250 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.38 
 
 
264 aa  123  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
257 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
258 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
262 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
270 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 
262 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.55 
 
 
262 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.55 
 
 
262 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574629 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  36.5 
 
 
663 aa  122  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  37.13 
 
 
258 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 
256 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.82 
 
 
258 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.18 
 
 
263 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.9 
 
 
273 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  36.93 
 
 
266 aa  121  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.45 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3078  short chain enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13392  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.02 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.63 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.52 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  36.41 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  42.36 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.81 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  35.68 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  39.32 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.86 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.85 
 
 
260 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
260 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.64 
 
 
259 aa  120  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
256 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  37.38 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.93 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.77 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.87 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  36.04 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.14 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 
276 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>