More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3551 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
259 aa  527  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.76 
 
 
287 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 
264 aa  258  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 
264 aa  230  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.05 
 
 
267 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.19 
 
 
273 aa  224  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.05 
 
 
265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.04 
 
 
264 aa  214  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
264 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 
269 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 
260 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.23 
 
 
267 aa  204  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
276 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.22 
 
 
263 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 
263 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 
263 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
258 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
263 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 
265 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
263 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
264 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
259 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
263 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
263 aa  158  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
264 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
279 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 
264 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
264 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
267 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
260 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
263 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.4 
 
 
262 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
268 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
260 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
261 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
269 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 
259 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
260 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35 
 
 
662 aa  149  4e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
259 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.5 
 
 
263 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.05 
 
 
256 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.46 
 
 
258 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 
267 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 
260 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
264 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.52 
 
 
659 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
266 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 
262 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
261 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
260 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
260 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
260 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  34.54 
 
 
260 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
267 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 
287 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
264 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 
267 aa  142  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
264 aa  142  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  31.1 
 
 
261 aa  142  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6847  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
268 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
262 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 
287 aa  142  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
267 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
268 aa  140  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.77 
 
 
262 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
262 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
265 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 
263 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.89 
 
 
260 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.27 
 
 
260 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.08 
 
 
662 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  36.13 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  32.52 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.9 
 
 
255 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.87 
 
 
259 aa  138  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.08 
 
 
662 aa  138  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>