More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0140 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  98.86 
 
 		 264 aa  530  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  84.79 
 
 		 265 aa  450  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.82 
 
 		 260 aa  275  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.22 
 
 		 269 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 		 287 aa  250  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  47.04 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.28 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.79 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 		 264 aa  214  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  44.11 
 
 		 276 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.43 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.6 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 		 267 aa  171  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 		 259 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.48 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 		 264 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4597  enoyl-CoA hydratase  39.27 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  33.46 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 264 aa  158  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.96 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 		 259 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 		 263 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 		 263 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 265 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.68 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.55 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  38.26 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.73 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6847  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.96 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 263 aa  141  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.6 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.72 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.1 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  39.31 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.57 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 		 265 aa  139  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.16 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  30.71 
 
 		 258 aa  138  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.92 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  31.66 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  31.33 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.52 
 
 		 262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 		 262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.36 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 		 262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>