More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1765 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
251 aa  491  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  50.4 
 
 
257 aa  248  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.36 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.98 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3457  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.04 
 
 
249 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.735617  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
261 aa  193  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0240  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
265 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0281  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.65 
 
 
265 aa  182  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11671  normal  0.186449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
266 aa  178  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
269 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  38.21 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 
274 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.94 
 
 
260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.52 
 
 
260 aa  151  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
258 aa  151  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.13 
 
 
260 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.67 
 
 
260 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6323  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.99 
 
 
261 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0881362  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 
259 aa  149  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
265 aa  148  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
254 aa  148  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
265 aa  148  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
257 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
260 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  36.4 
 
 
258 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  36.4 
 
 
258 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  38.26 
 
 
260 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.64 
 
 
256 aa  143  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.73 
 
 
245 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
260 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
260 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
260 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 
267 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.29 
 
 
260 aa  142  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
259 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 
260 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.74 
 
 
260 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  35.95 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.6 
 
 
277 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
261 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.88 
 
 
659 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6476  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 
463 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0587  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.56 
 
 
265 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.7 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
263 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
263 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  32.32 
 
 
280 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  32.32 
 
 
270 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 
260 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 
263 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
262 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.9 
 
 
269 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 
267 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
268 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
271 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
271 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  32.7 
 
 
270 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1378  methylmalonyl-CoA decarboxylase  33.73 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 
259 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
271 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0647  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.73 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 
253 aa  135  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
260 aa  135  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  32.7 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
260 aa  135  8e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
257 aa  134  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 
270 aa  135  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
263 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.36 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  39.25 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 
267 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
259 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 
268 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>