More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1841 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 270 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  94.44 
 
 		 270 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  94.07 
 
 		 280 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  93.7 
 
 		 280 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  80.74 
 
 		 270 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  80 
 
 		 270 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  78.52 
 
 		 270 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  79.26 
 
 		 270 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  74.63 
 
 		 270 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  73.51 
 
 		 270 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  54.89 
 
 		 270 aa  310  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  55.22 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.84 
 
 		 967 aa  295  8e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.08 
 
 		 284 aa  288  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  47.74 
 
 		 279 aa  277  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.82 
 
 		 291 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.01 
 
 		 284 aa  270  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.49 
 
 		 286 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.27 
 
 		 276 aa  254  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.89 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  43.73 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  44.94 
 
 		 274 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.39 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.26 
 
 		 277 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  44.78 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.85 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  41.79 
 
 		 274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  42.96 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.81 
 
 		 280 aa  208  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.7 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  40.5 
 
 		 291 aa  202  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  41.42 
 
 		 278 aa  194  9e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_006686  CND02600  conserved hypothetical protein  39.64 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.563575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  35 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  31.42 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 		 263 aa  148  7e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.96 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 265 aa  145  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.21 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.46 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.22 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.82 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.21 
 
 		 662 aa  143  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  30.48 
 
 		 258 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  30.48 
 
 		 258 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  30.48 
 
 		 258 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  30.11 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  36.16 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.45 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 		 260 aa  141  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.69 
 
 		 258 aa  141  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.97 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.21 
 
 		 659 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  30.11 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 		 258 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.96 
 
 		 260 aa  139  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.26 
 
 		 657 aa  138  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.11 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  31.34 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  30.71 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.56 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  30.71 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.1 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.66 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.18 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.96 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.2 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.96 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.72 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.33 
 
 		 663 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.09 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1904  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.7 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 		 270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>