More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5512 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
286 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.18 
 
 
286 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45.65 
 
 
279 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  47.25 
 
 
280 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.01 
 
 
284 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  46.89 
 
 
280 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 
270 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  49.01 
 
 
270 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.65 
 
 
277 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  43.59 
 
 
270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  46.52 
 
 
270 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  48.62 
 
 
270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.68 
 
 
291 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 
276 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.3 
 
 
284 aa  236  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  43.59 
 
 
270 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  43.96 
 
 
270 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  41.03 
 
 
270 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.84 
 
 
283 aa  228  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  42.12 
 
 
273 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.16 
 
 
280 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
270 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.39 
 
 
967 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  38.24 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.77 
 
 
274 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.78 
 
 
275 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  38.24 
 
 
271 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  38.24 
 
 
271 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  38.24 
 
 
271 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  38.66 
 
 
274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  36.03 
 
 
273 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  38.43 
 
 
280 aa  158  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  35.27 
 
 
291 aa  153  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.31 
 
 
281 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  38.26 
 
 
287 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  35.51 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_006686  CND02600  conserved hypothetical protein  37.44 
 
 
253 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.563575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.32 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  34.78 
 
 
657 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.56 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.05 
 
 
260 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.82 
 
 
659 aa  119  6e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 
275 aa  119  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.27 
 
 
657 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.8 
 
 
258 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  28.68 
 
 
663 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  32.92 
 
 
260 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.41 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.24 
 
 
259 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
259 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
277 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.54 
 
 
263 aa  112  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  30.88 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  34.74 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 
263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.91 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.29 
 
 
261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 
251 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.26 
 
 
257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0145  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.05 
 
 
260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.19 
 
 
662 aa  109  6e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.17 
 
 
260 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.74 
 
 
264 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.77 
 
 
260 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 
273 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
273 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.94 
 
 
260 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.8 
 
 
258 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.7 
 
 
267 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  31.5 
 
 
270 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
260 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.8 
 
 
258 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.58 
 
 
663 aa  106  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.74 
 
 
254 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5093  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
263 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382387 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.77 
 
 
260 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 
260 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 
253 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
260 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0643  short chain enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 
265 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0226779  normal  0.0998873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.1 
 
 
270 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.55 
 
 
271 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  30.6 
 
 
258 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.6 
 
 
258 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.63 
 
 
255 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.47 
 
 
662 aa  103  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  29.22 
 
 
258 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.29 
 
 
260 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.7 
 
 
262 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0044  short chain enoyl-CoA hydratase  34.2 
 
 
253 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>