More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1699 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.51 
 
 
283 aa  478  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.27 
 
 
286 aa  262  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.99 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.26 
 
 
284 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.35 
 
 
277 aa  245  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.71 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45 
 
 
279 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.54 
 
 
291 aa  229  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.16 
 
 
286 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  42.05 
 
 
270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
270 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  41.79 
 
 
280 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  41.29 
 
 
270 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  39.78 
 
 
270 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
270 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  41.04 
 
 
280 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  39.48 
 
 
270 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  39.11 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  39.48 
 
 
270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
275 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  38.2 
 
 
273 aa  188  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.84 
 
 
967 aa  188  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  39.47 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  39.47 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  39.47 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.97 
 
 
274 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  38.29 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
274 aa  162  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  35.98 
 
 
280 aa  156  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
287 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.72 
 
 
281 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  33.95 
 
 
291 aa  142  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  31.93 
 
 
278 aa  125  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.98 
 
 
662 aa  120  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.82 
 
 
661 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.09 
 
 
663 aa  117  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  27.65 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.74 
 
 
662 aa  112  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02600  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.563575  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.62 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
264 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.98 
 
 
662 aa  109  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.46 
 
 
258 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.27 
 
 
259 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.8 
 
 
260 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0145  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
247 aa  108  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  28.03 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  28.03 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  26.89 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.66 
 
 
258 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  30.94 
 
 
262 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 
263 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
280 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.35 
 
 
259 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
258 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.8 
 
 
260 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 
259 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.8 
 
 
651 aa  106  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.65 
 
 
657 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 
262 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.08 
 
 
260 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 
265 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  29.82 
 
 
657 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
275 aa  105  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 
277 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.08 
 
 
659 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  26.89 
 
 
258 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  26.89 
 
 
258 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1789  enoyl-CoA hydratase  31.27 
 
 
261 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  26.89 
 
 
258 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  26.89 
 
 
258 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  26.14 
 
 
258 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  26.89 
 
 
258 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  26.89 
 
 
258 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.77 
 
 
269 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 
260 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.27 
 
 
260 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  26.14 
 
 
258 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 
256 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 
263 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  31.68 
 
 
263 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.06 
 
 
267 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  28.97 
 
 
259 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.68 
 
 
267 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  29.3 
 
 
268 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  29.02 
 
 
262 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.52 
 
 
260 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.19 
 
 
277 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  29.23 
 
 
258 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 
257 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 
260 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  31.03 
 
 
261 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.52 
 
 
260 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1904  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
264 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302321  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>