More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0502 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
268 aa  550  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  58.58 
 
 
267 aa  294  9e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  55.88 
 
 
270 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  55.64 
 
 
270 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  55.88 
 
 
270 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  55.51 
 
 
270 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.99 
 
 
271 aa  281  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  57.14 
 
 
277 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  54.75 
 
 
280 aa  275  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  52.59 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.46 
 
 
275 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  54.17 
 
 
273 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  54.17 
 
 
273 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.83 
 
 
270 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  54.02 
 
 
266 aa  248  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.61 
 
 
269 aa  238  8e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.33 
 
 
266 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  51.35 
 
 
265 aa  221  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 
268 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  40.66 
 
 
268 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  40.25 
 
 
268 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  35.79 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  40.45 
 
 
356 aa  189  4e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  40.25 
 
 
268 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  39.83 
 
 
268 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 
299 aa  184  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  39.42 
 
 
268 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  41.87 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  40.42 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  40.42 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
268 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
269 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
268 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  38.75 
 
 
268 aa  168  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 
268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  37.32 
 
 
275 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.21 
 
 
967 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 
280 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  31.11 
 
 
270 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 
280 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.33 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  30.57 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  31.02 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  30.29 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  29.63 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.56 
 
 
284 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 
270 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  31.02 
 
 
270 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  29.93 
 
 
270 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.89 
 
 
284 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 
276 aa  118  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.03 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  31.56 
 
 
280 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.96 
 
 
281 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.43 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 
287 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.88 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.88 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  30.89 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 
274 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.15 
 
 
269 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  31.46 
 
 
271 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  31.46 
 
 
271 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  31.46 
 
 
271 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.98 
 
 
259 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.92 
 
 
271 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 
269 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.85 
 
 
291 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
271 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.4 
 
 
263 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 
260 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.9 
 
 
258 aa  106  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.72 
 
 
264 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
259 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.010448  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.02 
 
 
657 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.89 
 
 
254 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.25 
 
 
258 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 
257 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 
258 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
274 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.38 
 
 
260 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.7 
 
 
261 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  31.48 
 
 
273 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.06 
 
 
659 aa  103  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
280 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.53 
 
 
274 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.83 
 
 
261 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  28.95 
 
 
258 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  29.63 
 
 
258 aa  102  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 
260 aa  102  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>