More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0623 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 278 aa  558  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  70.86 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  63.31 
 
 		 268 aa  357  9e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  64.84 
 
 		 268 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  63.67 
 
 		 268 aa  349  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  62.23 
 
 		 268 aa  349  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  61.51 
 
 		 268 aa  349  3e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  63.67 
 
 		 268 aa  348  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  63.3 
 
 		 268 aa  346  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  61.87 
 
 		 268 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  61.51 
 
 		 268 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  61.51 
 
 		 268 aa  341  7e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  61.15 
 
 		 268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  60.43 
 
 		 268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  61.51 
 
 		 269 aa  330  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  58.63 
 
 		 268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  46.32 
 
 		 273 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  43.63 
 
 		 356 aa  199  5e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.98 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  41.87 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  44.88 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.45 
 
 		 275 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  44.02 
 
 		 270 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.96 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  42.08 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 270 aa  171  9e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.2 
 
 		 271 aa  168  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 		 280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  43.7 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 		 267 aa  148  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.65 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.73 
 
 		 266 aa  126  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  32.63 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 		 254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.55 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.59 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.03 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.34 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  35.24 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  32.79 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.64 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 		 267 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.74 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.65 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.32 
 
 		 659 aa  108  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 		 283 aa  108  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.65 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.11 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.38 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.11 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  29.11 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.27 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.84 
 
 		 657 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.69 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.23 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.11 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.01 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.29 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  34.21 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.01 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  30.94 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.01 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.56 
 
 		 263 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.85 
 
 		 662 aa  105  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.41 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.87 
 
 		 663 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.16 
 
 		 661 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.26 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1326  enoyl-CoA hydratase  32.59 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.63963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  28.75 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.04 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.22 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3020  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.15 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.3 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.88 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>